Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Rdh11Q9QYF1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Rdh11Q9QYF1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Rdh11Q9QYF1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rdh11Q9QYF1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rdh11Q9QYF1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rdh11Q9QYF1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rdh11Q9QYF1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rdh11Q9QYF1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rdh11Q9QYF1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Rdh11Q9QYF1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rdh11Q9QYF1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rdh11Q9QYF1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rdh11Q9QYF1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rdh11Q9QYF1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rdh11Q9QYF1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rdh11Q9QYF1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rdh11Q9QYF1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rdh11Q9QYF1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rdh11Q9QYF1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rdh11Q9QYF1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rdh11Q9QYF1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rdh11Q9QYF1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rdh11Q9QYF1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rdh11Q9QYF1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rdh11Q9QYF1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Rdh11Q9QYF1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Rdh11Q9QYF1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rdh11Q9QYF1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rdh11Q9QYF1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rdh11Q9QYF1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rdh11Q9QYF1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rdh11Q9QYF1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rdh11Q9QYF1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rdh11Q9QYF1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rdh11Q9QYF1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rdh11Q9QYF1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rdh11Q9QYF1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rdh11Q9QYF1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rdh11Q9QYF1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rdh11Q9QYF1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rdh11Q9QYF1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rdh11Q9QYF1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rdh11Q9QYF1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rdh11Q9QYF1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rdh11Q9QYF1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rdh11Q9QYF1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rdh11Q9QYF1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rdh11Q9QYF1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rdh11Q9QYF1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rdh11Q9QYF1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rdh11Q9QYF1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rdh11Q9QYF1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rdh11Q9QYF1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rdh11Q9QYF1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rdh11Q9QYF1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rdh11Q9QYF1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Rdh11Q9QYF1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rdh11Q9QYF1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rdh11Q9QYF1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rdh11Q9QYF1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rdh11Q9QYF1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Rdh11Q9QYF1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rdh11Q9QYF1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rdh11Q9QYF1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rdh11Q9QYF1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rdh11Q9QYF1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rdh11Q9QYF1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rdh11Q9QYF1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rdh11Q9QYF1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rdh11Q9QYF1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rdh11Q9QYF1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rdh11Q9QYF1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rdh11Q9QYF1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rdh11Q9QYF1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rdh11Q9QYF1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
Rdh11Q9QYF1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rdh11Q9QYF1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rdh11Q9QYF1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rdh11Q9QYF1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rdh11Q9QYF1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rdh11Q9QYF1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rdh11Q9QYF1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rdh11Q9QYF1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rdh11Q9QYF1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rdh11Q9QYF1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rdh11Q9QYF1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rdh11Q9QYF1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rdh11Q9QYF1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rdh11Q9QYF1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rdh11Q9QYF1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rdh11Q9QYF1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rdh11Q9QYF1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rdh11Q9QYF1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rdh11Q9QYF1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rdh11Q9QYF1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Rdh11Q9QYF1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rdh11Q9QYF1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rdh11Q9QYF1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rdh11Q9QYF1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms