Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY14

Foxe3, Forkhead box protein E3, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxe3Q9QY14 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Foxe3Q9QY14 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Foxe3Q9QY14 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Foxe3Q9QY14 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Foxe3Q9QY14 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Foxe3Q9QY14 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Foxe3Q9QY14 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Foxe3Q9QY14 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Foxe3Q9QY14 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Foxe3Q9QY14 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Foxe3Q9QY14 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Foxe3Q9QY14 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Foxe3Q9QY14 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Foxe3Q9QY14 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Foxe3Q9QY14 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Foxe3Q9QY14 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Foxe3Q9QY14 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Foxe3Q9QY14 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Foxe3Q9QY14 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Foxe3Q9QY14 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Foxe3Q9QY14 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Foxe3Q9QY14 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Foxe3Q9QY14 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Foxe3Q9QY14 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Foxe3Q9QY14 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Foxe3Q9QY14 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Foxe3Q9QY14 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Foxe3Q9QY14 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Foxe3Q9QY14 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Foxe3Q9QY14 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Foxe3Q9QY14 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Foxe3Q9QY14 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Foxe3Q9QY14 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Foxe3Q9QY14 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Foxe3Q9QY14 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Foxe3Q9QY14 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Foxe3Q9QY14 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Foxe3Q9QY14 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Foxe3Q9QY14 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Foxe3Q9QY14 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Foxe3Q9QY14 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Foxe3Q9QY14 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Foxe3Q9QY14 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Foxe3Q9QY14 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Foxe3Q9QY14 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Foxe3Q9QY14 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Foxe3Q9QY14 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Foxe3Q9QY14 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Foxe3Q9QY14 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Foxe3Q9QY14 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Foxe3Q9QY14 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Foxe3Q9QY14 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Foxe3Q9QY14 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Foxe3Q9QY14 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Foxe3Q9QY14 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Foxe3Q9QY14 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Foxe3Q9QY14 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Foxe3Q9QY14 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Foxe3Q9QY14 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Foxe3Q9QY14 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Foxe3Q9QY14 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Foxe3Q9QY14 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Foxe3Q9QY14 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Foxe3Q9QY14 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Foxe3Q9QY14 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Foxe3Q9QY14 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Foxe3Q9QY14 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Foxe3Q9QY14 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Foxe3Q9QY14 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Foxe3Q9QY14 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Foxe3Q9QY14 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Foxe3Q9QY14 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Foxe3Q9QY14 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Foxe3Q9QY14 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Foxe3Q9QY14 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Foxe3Q9QY14 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Foxe3Q9QY14 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Foxe3Q9QY14 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Foxe3Q9QY14 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Foxe3Q9QY14 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Foxe3Q9QY14 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Foxe3Q9QY14 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Foxe3Q9QY14 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Foxe3Q9QY14 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Foxe3Q9QY14 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Foxe3Q9QY14 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Foxe3Q9QY14 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Foxe3Q9QY14 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Foxe3Q9QY14 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Foxe3Q9QY14 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Foxe3Q9QY14 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Foxe3Q9QY14 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Foxe3Q9QY14 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Foxe3Q9QY14 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Foxe3Q9QY14 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Foxe3Q9QY14 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Foxe3Q9QY14 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Foxe3Q9QY14 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Foxe3Q9QY14 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Foxe3Q9QY14 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms