Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nr2e3Q9QXZ7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nr2e3Q9QXZ7 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Nr2e3Q9QXZ7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nr2e3Q9QXZ7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nr2e3Q9QXZ7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nr2e3Q9QXZ7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nr2e3Q9QXZ7 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nr2e3Q9QXZ7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nr2e3Q9QXZ7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nr2e3Q9QXZ7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nr2e3Q9QXZ7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nr2e3Q9QXZ7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nr2e3Q9QXZ7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nr2e3Q9QXZ7 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nr2e3Q9QXZ7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nr2e3Q9QXZ7 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nr2e3Q9QXZ7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nr2e3Q9QXZ7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nr2e3Q9QXZ7 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nr2e3Q9QXZ7 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nr2e3Q9QXZ7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nr2e3Q9QXZ7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nr2e3Q9QXZ7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nr2e3Q9QXZ7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Nr2e3Q9QXZ7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nr2e3Q9QXZ7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nr2e3Q9QXZ7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nr2e3Q9QXZ7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nr2e3Q9QXZ7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nr2e3Q9QXZ7 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nr2e3Q9QXZ7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nr2e3Q9QXZ7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nr2e3Q9QXZ7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nr2e3Q9QXZ7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nr2e3Q9QXZ7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nr2e3Q9QXZ7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nr2e3Q9QXZ7 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nr2e3Q9QXZ7 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nr2e3Q9QXZ7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nr2e3Q9QXZ7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nr2e3Q9QXZ7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nr2e3Q9QXZ7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nr2e3Q9QXZ7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nr2e3Q9QXZ7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nr2e3Q9QXZ7 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nr2e3Q9QXZ7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nr2e3Q9QXZ7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nr2e3Q9QXZ7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nr2e3Q9QXZ7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nr2e3Q9QXZ7 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Nr2e3Q9QXZ7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nr2e3Q9QXZ7 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Nr2e3Q9QXZ7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nr2e3Q9QXZ7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nr2e3Q9QXZ7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nr2e3Q9QXZ7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nr2e3Q9QXZ7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nr2e3Q9QXZ7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nr2e3Q9QXZ7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nr2e3Q9QXZ7 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nr2e3Q9QXZ7 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nr2e3Q9QXZ7 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nr2e3Q9QXZ7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nr2e3Q9QXZ7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nr2e3Q9QXZ7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nr2e3Q9QXZ7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nr2e3Q9QXZ7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nr2e3Q9QXZ7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nr2e3Q9QXZ7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nr2e3Q9QXZ7 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nr2e3Q9QXZ7 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nr2e3Q9QXZ7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nr2e3Q9QXZ7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nr2e3Q9QXZ7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nr2e3Q9QXZ7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nr2e3Q9QXZ7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nr2e3Q9QXZ7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nr2e3Q9QXZ7 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Nr2e3Q9QXZ7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Nr2e3Q9QXZ7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nr2e3Q9QXZ7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nr2e3Q9QXZ7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nr2e3Q9QXZ7 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nr2e3Q9QXZ7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nr2e3Q9QXZ7 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nr2e3Q9QXZ7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nr2e3Q9QXZ7 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nr2e3Q9QXZ7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nr2e3Q9QXZ7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nr2e3Q9QXZ7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nr2e3Q9QXZ7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nr2e3Q9QXZ7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nr2e3Q9QXZ7 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nr2e3Q9QXZ7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nr2e3Q9QXZ7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms