Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK7

Cpsf3, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf3Q9QXK7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cpsf3Q9QXK7 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Cpsf3Q9QXK7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cpsf3Q9QXK7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cpsf3Q9QXK7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cpsf3Q9QXK7 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cpsf3Q9QXK7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cpsf3Q9QXK7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cpsf3Q9QXK7 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Cpsf3Q9QXK7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cpsf3Q9QXK7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cpsf3Q9QXK7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cpsf3Q9QXK7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cpsf3Q9QXK7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cpsf3Q9QXK7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cpsf3Q9QXK7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cpsf3Q9QXK7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cpsf3Q9QXK7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cpsf3Q9QXK7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cpsf3Q9QXK7 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cpsf3Q9QXK7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cpsf3Q9QXK7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cpsf3Q9QXK7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cpsf3Q9QXK7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cpsf3Q9QXK7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cpsf3Q9QXK7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cpsf3Q9QXK7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cpsf3Q9QXK7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cpsf3Q9QXK7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cpsf3Q9QXK7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cpsf3Q9QXK7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cpsf3Q9QXK7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cpsf3Q9QXK7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cpsf3Q9QXK7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cpsf3Q9QXK7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cpsf3Q9QXK7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cpsf3Q9QXK7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cpsf3Q9QXK7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cpsf3Q9QXK7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cpsf3Q9QXK7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cpsf3Q9QXK7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cpsf3Q9QXK7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cpsf3Q9QXK7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cpsf3Q9QXK7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cpsf3Q9QXK7 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Cpsf3Q9QXK7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cpsf3Q9QXK7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cpsf3Q9QXK7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cpsf3Q9QXK7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cpsf3Q9QXK7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cpsf3Q9QXK7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cpsf3Q9QXK7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cpsf3Q9QXK7 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cpsf3Q9QXK7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cpsf3Q9QXK7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Cpsf3Q9QXK7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cpsf3Q9QXK7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cpsf3Q9QXK7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cpsf3Q9QXK7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cpsf3Q9QXK7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cpsf3Q9QXK7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cpsf3Q9QXK7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cpsf3Q9QXK7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cpsf3Q9QXK7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cpsf3Q9QXK7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cpsf3Q9QXK7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cpsf3Q9QXK7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cpsf3Q9QXK7 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cpsf3Q9QXK7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cpsf3Q9QXK7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cpsf3Q9QXK7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cpsf3Q9QXK7 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cpsf3Q9QXK7 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Cpsf3Q9QXK7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Cpsf3Q9QXK7 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Cpsf3Q9QXK7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cpsf3Q9QXK7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cpsf3Q9QXK7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cpsf3Q9QXK7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cpsf3Q9QXK7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cpsf3Q9QXK7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cpsf3Q9QXK7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cpsf3Q9QXK7 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cpsf3Q9QXK7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cpsf3Q9QXK7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cpsf3Q9QXK7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cpsf3Q9QXK7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cpsf3Q9QXK7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cpsf3Q9QXK7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cpsf3Q9QXK7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cpsf3Q9QXK7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cpsf3Q9QXK7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cpsf3Q9QXK7 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Cpsf3Q9QXK7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cpsf3Q9QXK7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cpsf3Q9QXK7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cpsf3Q9QXK7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cpsf3Q9QXK7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cpsf3Q9QXK7 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cpsf3Q9QXK7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms