Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Limd1Q9QXD8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Limd1Q9QXD8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Limd1Q9QXD8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Limd1Q9QXD8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Limd1Q9QXD8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Limd1Q9QXD8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Limd1Q9QXD8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Limd1Q9QXD8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Limd1Q9QXD8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Limd1Q9QXD8 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Limd1Q9QXD8 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Limd1Q9QXD8 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Limd1Q9QXD8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Limd1Q9QXD8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Limd1Q9QXD8 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Limd1Q9QXD8 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Limd1Q9QXD8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Limd1Q9QXD8 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Limd1Q9QXD8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Limd1Q9QXD8 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Limd1Q9QXD8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Limd1Q9QXD8 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Limd1Q9QXD8 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Limd1Q9QXD8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Limd1Q9QXD8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Limd1Q9QXD8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Limd1Q9QXD8 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Limd1Q9QXD8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Limd1Q9QXD8 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Limd1Q9QXD8 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Limd1Q9QXD8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Limd1Q9QXD8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Limd1Q9QXD8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Limd1Q9QXD8 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Limd1Q9QXD8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Limd1Q9QXD8 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Limd1Q9QXD8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Limd1Q9QXD8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Limd1Q9QXD8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Limd1Q9QXD8 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Limd1Q9QXD8 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Limd1Q9QXD8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Limd1Q9QXD8 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Limd1Q9QXD8 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Limd1Q9QXD8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Limd1Q9QXD8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Limd1Q9QXD8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Limd1Q9QXD8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Limd1Q9QXD8 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Limd1Q9QXD8 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Limd1Q9QXD8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Limd1Q9QXD8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Limd1Q9QXD8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Limd1Q9QXD8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Limd1Q9QXD8 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Limd1Q9QXD8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Limd1Q9QXD8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Limd1Q9QXD8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Limd1Q9QXD8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Limd1Q9QXD8 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Limd1Q9QXD8 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Limd1Q9QXD8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Limd1Q9QXD8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Limd1Q9QXD8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Limd1Q9QXD8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Limd1Q9QXD8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Limd1Q9QXD8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Limd1Q9QXD8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Limd1Q9QXD8 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Limd1Q9QXD8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Limd1Q9QXD8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Limd1Q9QXD8 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Limd1Q9QXD8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Limd1Q9QXD8 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Limd1Q9QXD8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Limd1Q9QXD8 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Limd1Q9QXD8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Limd1Q9QXD8 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Limd1Q9QXD8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Limd1Q9QXD8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Limd1Q9QXD8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Limd1Q9QXD8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Limd1Q9QXD8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Limd1Q9QXD8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Limd1Q9QXD8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Limd1Q9QXD8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Limd1Q9QXD8 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Limd1Q9QXD8 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Limd1Q9QXD8 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Limd1Q9QXD8 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Limd1Q9QXD8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Limd1Q9QXD8 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Limd1Q9QXD8 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Limd1Q9QXD8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Limd1Q9QXD8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Limd1Q9QXD8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Limd1Q9QXD8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Limd1Q9QXD8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Limd1Q9QXD8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
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