Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVN7

Tcea2, Transcription elongation factor A protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea2Q9QVN7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tcea2Q9QVN7 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tcea2Q9QVN7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tcea2Q9QVN7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tcea2Q9QVN7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tcea2Q9QVN7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tcea2Q9QVN7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tcea2Q9QVN7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tcea2Q9QVN7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tcea2Q9QVN7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tcea2Q9QVN7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tcea2Q9QVN7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms