Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csnk1eQ9JMK2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csnk1eQ9JMK2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csnk1eQ9JMK2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csnk1eQ9JMK2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csnk1eQ9JMK2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Csnk1eQ9JMK2 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csnk1eQ9JMK2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csnk1eQ9JMK2 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csnk1eQ9JMK2 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csnk1eQ9JMK2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csnk1eQ9JMK2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csnk1eQ9JMK2 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csnk1eQ9JMK2 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csnk1eQ9JMK2 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csnk1eQ9JMK2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Csnk1eQ9JMK2 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csnk1eQ9JMK2 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Csnk1eQ9JMK2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csnk1eQ9JMK2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csnk1eQ9JMK2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csnk1eQ9JMK2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Csnk1eQ9JMK2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Csnk1eQ9JMK2 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Csnk1eQ9JMK2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csnk1eQ9JMK2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csnk1eQ9JMK2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csnk1eQ9JMK2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csnk1eQ9JMK2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csnk1eQ9JMK2 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csnk1eQ9JMK2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csnk1eQ9JMK2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csnk1eQ9JMK2 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csnk1eQ9JMK2 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Csnk1eQ9JMK2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csnk1eQ9JMK2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csnk1eQ9JMK2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csnk1eQ9JMK2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csnk1eQ9JMK2 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csnk1eQ9JMK2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csnk1eQ9JMK2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Csnk1eQ9JMK2 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Csnk1eQ9JMK2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csnk1eQ9JMK2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csnk1eQ9JMK2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csnk1eQ9JMK2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csnk1eQ9JMK2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csnk1eQ9JMK2 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csnk1eQ9JMK2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csnk1eQ9JMK2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csnk1eQ9JMK2 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csnk1eQ9JMK2 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Csnk1eQ9JMK2 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csnk1eQ9JMK2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csnk1eQ9JMK2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csnk1eQ9JMK2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csnk1eQ9JMK2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csnk1eQ9JMK2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csnk1eQ9JMK2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csnk1eQ9JMK2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csnk1eQ9JMK2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csnk1eQ9JMK2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms