Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG4

Nkain4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkain4Q9JMG4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkain4Q9JMG4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkain4Q9JMG4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkain4Q9JMG4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkain4Q9JMG4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkain4Q9JMG4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkain4Q9JMG4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkain4Q9JMG4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkain4Q9JMG4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkain4Q9JMG4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkain4Q9JMG4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkain4Q9JMG4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkain4Q9JMG4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkain4Q9JMG4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkain4Q9JMG4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkain4Q9JMG4 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkain4Q9JMG4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkain4Q9JMG4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkain4Q9JMG4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkain4Q9JMG4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkain4Q9JMG4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkain4Q9JMG4 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkain4Q9JMG4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkain4Q9JMG4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkain4Q9JMG4 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkain4Q9JMG4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkain4Q9JMG4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkain4Q9JMG4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkain4Q9JMG4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkain4Q9JMG4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkain4Q9JMG4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkain4Q9JMG4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkain4Q9JMG4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkain4Q9JMG4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkain4Q9JMG4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkain4Q9JMG4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkain4Q9JMG4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkain4Q9JMG4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkain4Q9JMG4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkain4Q9JMG4 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkain4Q9JMG4 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkain4Q9JMG4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkain4Q9JMG4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkain4Q9JMG4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkain4Q9JMG4 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkain4Q9JMG4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkain4Q9JMG4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkain4Q9JMG4 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkain4Q9JMG4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkain4Q9JMG4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkain4Q9JMG4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkain4Q9JMG4 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkain4Q9JMG4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkain4Q9JMG4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkain4Q9JMG4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkain4Q9JMG4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkain4Q9JMG4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkain4Q9JMG4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkain4Q9JMG4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkain4Q9JMG4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkain4Q9JMG4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkain4Q9JMG4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkain4Q9JMG4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkain4Q9JMG4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkain4Q9JMG4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkain4Q9JMG4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkain4Q9JMG4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkain4Q9JMG4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkain4Q9JMG4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkain4Q9JMG4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkain4Q9JMG4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkain4Q9JMG4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkain4Q9JMG4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkain4Q9JMG4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkain4Q9JMG4 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkain4Q9JMG4 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkain4Q9JMG4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkain4Q9JMG4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkain4Q9JMG4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkain4Q9JMG4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkain4Q9JMG4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkain4Q9JMG4 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkain4Q9JMG4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkain4Q9JMG4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkain4Q9JMG4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkain4Q9JMG4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkain4Q9JMG4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkain4Q9JMG4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkain4Q9JMG4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkain4Q9JMG4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkain4Q9JMG4 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkain4Q9JMG4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkain4Q9JMG4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkain4Q9JMG4 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkain4Q9JMG4 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkain4Q9JMG4 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nkain4Q9JMG4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkain4Q9JMG4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nkain4Q9JMG4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkain4Q9JMG4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms