Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME2

Chst11, Carbohydrate sulfotransferase 11, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chst11Q9JME2 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chst11Q9JME2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chst11Q9JME2 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Chst11Q9JME2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chst11Q9JME2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chst11Q9JME2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chst11Q9JME2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chst11Q9JME2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chst11Q9JME2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chst11Q9JME2 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chst11Q9JME2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chst11Q9JME2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chst11Q9JME2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chst11Q9JME2 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chst11Q9JME2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chst11Q9JME2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chst11Q9JME2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chst11Q9JME2 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Chst11Q9JME2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chst11Q9JME2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chst11Q9JME2 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chst11Q9JME2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chst11Q9JME2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chst11Q9JME2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chst11Q9JME2 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chst11Q9JME2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Chst11Q9JME2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Chst11Q9JME2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chst11Q9JME2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chst11Q9JME2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chst11Q9JME2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chst11Q9JME2 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chst11Q9JME2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chst11Q9JME2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chst11Q9JME2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chst11Q9JME2 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Chst11Q9JME2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Chst11Q9JME2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chst11Q9JME2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chst11Q9JME2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chst11Q9JME2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chst11Q9JME2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chst11Q9JME2 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chst11Q9JME2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chst11Q9JME2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chst11Q9JME2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chst11Q9JME2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chst11Q9JME2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chst11Q9JME2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chst11Q9JME2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chst11Q9JME2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chst11Q9JME2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chst11Q9JME2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chst11Q9JME2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chst11Q9JME2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chst11Q9JME2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chst11Q9JME2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chst11Q9JME2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chst11Q9JME2 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Chst11Q9JME2 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Chst11Q9JME2 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chst11Q9JME2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chst11Q9JME2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chst11Q9JME2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chst11Q9JME2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chst11Q9JME2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chst11Q9JME2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Chst11Q9JME2 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chst11Q9JME2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chst11Q9JME2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chst11Q9JME2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chst11Q9JME2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Chst11Q9JME2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chst11Q9JME2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chst11Q9JME2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chst11Q9JME2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Chst11Q9JME2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chst11Q9JME2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chst11Q9JME2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chst11Q9JME2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chst11Q9JME2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chst11Q9JME2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chst11Q9JME2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chst11Q9JME2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chst11Q9JME2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chst11Q9JME2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chst11Q9JME2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chst11Q9JME2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chst11Q9JME2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chst11Q9JME2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chst11Q9JME2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chst11Q9JME2 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chst11Q9JME2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Chst11Q9JME2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chst11Q9JME2 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chst11Q9JME2 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Chst11Q9JME2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chst11Q9JME2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chst11Q9JME2 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chst11Q9JME2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms