Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sfmbt1Q9JMD1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sfmbt1Q9JMD1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sfmbt1Q9JMD1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sfmbt1Q9JMD1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sfmbt1Q9JMD1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sfmbt1Q9JMD1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sfmbt1Q9JMD1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Sfmbt1Q9JMD1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sfmbt1Q9JMD1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sfmbt1Q9JMD1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Sfmbt1Q9JMD1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sfmbt1Q9JMD1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sfmbt1Q9JMD1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Sfmbt1Q9JMD1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Sfmbt1Q9JMD1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sfmbt1Q9JMD1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sfmbt1Q9JMD1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sfmbt1Q9JMD1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Sfmbt1Q9JMD1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sfmbt1Q9JMD1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sfmbt1Q9JMD1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sfmbt1Q9JMD1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Sfmbt1Q9JMD1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sfmbt1Q9JMD1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Sfmbt1Q9JMD1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sfmbt1Q9JMD1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Sfmbt1Q9JMD1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sfmbt1Q9JMD1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sfmbt1Q9JMD1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sfmbt1Q9JMD1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sfmbt1Q9JMD1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sfmbt1Q9JMD1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sfmbt1Q9JMD1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sfmbt1Q9JMD1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sfmbt1Q9JMD1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sfmbt1Q9JMD1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sfmbt1Q9JMD1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sfmbt1Q9JMD1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sfmbt1Q9JMD1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sfmbt1Q9JMD1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sfmbt1Q9JMD1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Sfmbt1Q9JMD1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sfmbt1Q9JMD1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sfmbt1Q9JMD1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sfmbt1Q9JMD1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sfmbt1Q9JMD1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sfmbt1Q9JMD1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sfmbt1Q9JMD1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sfmbt1Q9JMD1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sfmbt1Q9JMD1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sfmbt1Q9JMD1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sfmbt1Q9JMD1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Sfmbt1Q9JMD1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sfmbt1Q9JMD1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sfmbt1Q9JMD1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sfmbt1Q9JMD1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sfmbt1Q9JMD1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sfmbt1Q9JMD1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sfmbt1Q9JMD1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sfmbt1Q9JMD1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sfmbt1Q9JMD1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms