Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SrfQ9JM73 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SrfQ9JM73 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SrfQ9JM73 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SrfQ9JM73 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SrfQ9JM73 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SrfQ9JM73 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SrfQ9JM73 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SrfQ9JM73 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SrfQ9JM73 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SrfQ9JM73 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SrfQ9JM73 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SrfQ9JM73 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SrfQ9JM73 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SrfQ9JM73 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SrfQ9JM73 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SrfQ9JM73 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SrfQ9JM73 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SrfQ9JM73 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SrfQ9JM73 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SrfQ9JM73 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SrfQ9JM73 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SrfQ9JM73 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SrfQ9JM73 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SrfQ9JM73 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SrfQ9JM73 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SrfQ9JM73 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SrfQ9JM73 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SrfQ9JM73 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SrfQ9JM73 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SrfQ9JM73 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SrfQ9JM73 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SrfQ9JM73 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SrfQ9JM73 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SrfQ9JM73 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SrfQ9JM73 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SrfQ9JM73 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SrfQ9JM73 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SrfQ9JM73 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SrfQ9JM73 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrfQ9JM73 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrfQ9JM73 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrfQ9JM73 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrfQ9JM73 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrfQ9JM73 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrfQ9JM73 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SrfQ9JM73 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrfQ9JM73 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrfQ9JM73 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SrfQ9JM73 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SrfQ9JM73 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrfQ9JM73 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrfQ9JM73 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrfQ9JM73 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrfQ9JM73 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrfQ9JM73 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrfQ9JM73 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrfQ9JM73 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrfQ9JM73 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SrfQ9JM73 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SrfQ9JM73 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrfQ9JM73 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrfQ9JM73 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrfQ9JM73 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrfQ9JM73 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrfQ9JM73 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrfQ9JM73 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrfQ9JM73 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrfQ9JM73 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SrfQ9JM73 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrfQ9JM73 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrfQ9JM73 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrfQ9JM73 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrfQ9JM73 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SrfQ9JM73 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrfQ9JM73 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrfQ9JM73 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrfQ9JM73 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SrfQ9JM73 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SrfQ9JM73 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SrfQ9JM73 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SrfQ9JM73 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SrfQ9JM73 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SrfQ9JM73 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrfQ9JM73 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms