Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rabgef1Q9JM13 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Rabgef1Q9JM13 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Rabgef1Q9JM13 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rabgef1Q9JM13 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rabgef1Q9JM13 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rabgef1Q9JM13 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rabgef1Q9JM13 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rabgef1Q9JM13 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rabgef1Q9JM13 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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Rabgef1Q9JM13 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rabgef1Q9JM13 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rabgef1Q9JM13 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rabgef1Q9JM13 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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Rabgef1Q9JM13 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rabgef1Q9JM13 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rabgef1Q9JM13 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rabgef1Q9JM13 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rabgef1Q9JM13 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rabgef1Q9JM13 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rabgef1Q9JM13 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
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Rabgef1Q9JM13 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rabgef1Q9JM13 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rabgef1Q9JM13 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rabgef1Q9JM13 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rabgef1Q9JM13 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rabgef1Q9JM13 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rabgef1Q9JM13 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rabgef1Q9JM13 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rabgef1Q9JM13 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rabgef1Q9JM13 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rabgef1Q9JM13 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rabgef1Q9JM13 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rabgef1Q9JM13 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rabgef1Q9JM13 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rabgef1Q9JM13 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rabgef1Q9JM13 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rabgef1Q9JM13 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rabgef1Q9JM13 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rabgef1Q9JM13 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rabgef1Q9JM13 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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