Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gde1Q9JL56 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gde1Q9JL56 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gde1Q9JL56 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gde1Q9JL56 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gde1Q9JL56 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gde1Q9JL56 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gde1Q9JL56 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gde1Q9JL56 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gde1Q9JL56 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gde1Q9JL56 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gde1Q9JL56 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gde1Q9JL56 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gde1Q9JL56 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gde1Q9JL56 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gde1Q9JL56 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gde1Q9JL56 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gde1Q9JL56 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gde1Q9JL56 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gde1Q9JL56 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gde1Q9JL56 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gde1Q9JL56 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gde1Q9JL56 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gde1Q9JL56 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gde1Q9JL56 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gde1Q9JL56 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gde1Q9JL56 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gde1Q9JL56 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gde1Q9JL56 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gde1Q9JL56 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gde1Q9JL56 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gde1Q9JL56 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gde1Q9JL56 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gde1Q9JL56 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gde1Q9JL56 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gde1Q9JL56 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gde1Q9JL56 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gde1Q9JL56 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gde1Q9JL56 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gde1Q9JL56 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gde1Q9JL56 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gde1Q9JL56 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gde1Q9JL56 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gde1Q9JL56 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gde1Q9JL56 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gde1Q9JL56 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gde1Q9JL56 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gde1Q9JL56 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gde1Q9JL56 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gde1Q9JL56 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gde1Q9JL56 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gde1Q9JL56 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gde1Q9JL56 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gde1Q9JL56 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gde1Q9JL56 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gde1Q9JL56 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gde1Q9JL56 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gde1Q9JL56 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gde1Q9JL56 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gde1Q9JL56 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gde1Q9JL56 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gde1Q9JL56 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gde1Q9JL56 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gde1Q9JL56 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gde1Q9JL56 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gde1Q9JL56 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gde1Q9JL56 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gde1Q9JL56 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gde1Q9JL56 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gde1Q9JL56 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gde1Q9JL56 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gde1Q9JL56 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gde1Q9JL56 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gde1Q9JL56 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gde1Q9JL56 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gde1Q9JL56 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gde1Q9JL56 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gde1Q9JL56 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gde1Q9JL56 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gde1Q9JL56 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gde1Q9JL56 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gde1Q9JL56 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gde1Q9JL56 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gde1Q9JL56 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gde1Q9JL56 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gde1Q9JL56 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gde1Q9JL56 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gde1Q9JL56 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gde1Q9JL56 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gde1Q9JL56 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gde1Q9JL56 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gde1Q9JL56 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gde1Q9JL56 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gde1Q9JL56 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gde1Q9JL56 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gde1Q9JL56 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gde1Q9JL56 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gde1Q9JL56 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gde1Q9JL56 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gde1Q9JL56 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms