Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scamp4Q9JKV5 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scamp4Q9JKV5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms