Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AtrQ9JKK8 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
AtrQ9JKK8 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms