Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cyp39a1Q9JKJ9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cyp39a1Q9JKJ9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cyp39a1Q9JKJ9 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cyp39a1Q9JKJ9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cyp39a1Q9JKJ9 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cyp39a1Q9JKJ9 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cyp39a1Q9JKJ9 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cyp39a1Q9JKJ9 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms