Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gfra4Q9JJT2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gfra4Q9JJT2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gfra4Q9JJT2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gfra4Q9JJT2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gfra4Q9JJT2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gfra4Q9JJT2 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gfra4Q9JJT2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gfra4Q9JJT2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Gfra4Q9JJT2 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gfra4Q9JJT2 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Gfra4Q9JJT2 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gfra4Q9JJT2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gfra4Q9JJT2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gfra4Q9JJT2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gfra4Q9JJT2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gfra4Q9JJT2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Gfra4Q9JJT2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gfra4Q9JJT2 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gfra4Q9JJT2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gfra4Q9JJT2 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gfra4Q9JJT2 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gfra4Q9JJT2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gfra4Q9JJT2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gfra4Q9JJT2 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Gfra4Q9JJT2 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gfra4Q9JJT2 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gfra4Q9JJT2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gfra4Q9JJT2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gfra4Q9JJT2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gfra4Q9JJT2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gfra4Q9JJT2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gfra4Q9JJT2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gfra4Q9JJT2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gfra4Q9JJT2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gfra4Q9JJT2 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gfra4Q9JJT2 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gfra4Q9JJT2 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gfra4Q9JJT2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gfra4Q9JJT2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gfra4Q9JJT2 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gfra4Q9JJT2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gfra4Q9JJT2 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gfra4Q9JJT2 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gfra4Q9JJT2 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gfra4Q9JJT2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gfra4Q9JJT2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gfra4Q9JJT2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gfra4Q9JJT2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gfra4Q9JJT2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gfra4Q9JJT2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gfra4Q9JJT2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gfra4Q9JJT2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gfra4Q9JJT2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gfra4Q9JJT2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gfra4Q9JJT2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gfra4Q9JJT2 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gfra4Q9JJT2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gfra4Q9JJT2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gfra4Q9JJT2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gfra4Q9JJT2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gfra4Q9JJT2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gfra4Q9JJT2 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gfra4Q9JJT2 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gfra4Q9JJT2 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gfra4Q9JJT2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gfra4Q9JJT2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gfra4Q9JJT2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gfra4Q9JJT2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gfra4Q9JJT2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gfra4Q9JJT2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gfra4Q9JJT2 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Gfra4Q9JJT2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gfra4Q9JJT2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gfra4Q9JJT2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gfra4Q9JJT2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gfra4Q9JJT2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gfra4Q9JJT2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gfra4Q9JJT2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gfra4Q9JJT2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gfra4Q9JJT2 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gfra4Q9JJT2 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gfra4Q9JJT2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gfra4Q9JJT2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gfra4Q9JJT2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gfra4Q9JJT2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gfra4Q9JJT2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gfra4Q9JJT2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gfra4Q9JJT2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gfra4Q9JJT2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gfra4Q9JJT2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gfra4Q9JJT2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gfra4Q9JJT2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gfra4Q9JJT2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gfra4Q9JJT2 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gfra4Q9JJT2 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gfra4Q9JJT2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gfra4Q9JJT2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gfra4Q9JJT2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gfra4Q9JJT2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms