Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJQ0

Pigb, GPI mannosyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PigbQ9JJQ0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PigbQ9JJQ0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PigbQ9JJQ0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PigbQ9JJQ0 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PigbQ9JJQ0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PigbQ9JJQ0 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PigbQ9JJQ0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PigbQ9JJQ0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PigbQ9JJQ0 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PigbQ9JJQ0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PigbQ9JJQ0 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PigbQ9JJQ0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PigbQ9JJQ0 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PigbQ9JJQ0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PigbQ9JJQ0 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PigbQ9JJQ0 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PigbQ9JJQ0 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PigbQ9JJQ0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PigbQ9JJQ0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PigbQ9JJQ0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PigbQ9JJQ0 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PigbQ9JJQ0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PigbQ9JJQ0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PigbQ9JJQ0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PigbQ9JJQ0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PigbQ9JJQ0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PigbQ9JJQ0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PigbQ9JJQ0 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PigbQ9JJQ0 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PigbQ9JJQ0 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PigbQ9JJQ0 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PigbQ9JJQ0 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PigbQ9JJQ0 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PigbQ9JJQ0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PigbQ9JJQ0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PigbQ9JJQ0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PigbQ9JJQ0 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PigbQ9JJQ0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PigbQ9JJQ0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PigbQ9JJQ0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PigbQ9JJQ0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PigbQ9JJQ0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PigbQ9JJQ0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PigbQ9JJQ0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PigbQ9JJQ0 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PigbQ9JJQ0 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PigbQ9JJQ0 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PigbQ9JJQ0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PigbQ9JJQ0 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PigbQ9JJQ0 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PigbQ9JJQ0 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PigbQ9JJQ0 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PigbQ9JJQ0 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PigbQ9JJQ0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PigbQ9JJQ0 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PigbQ9JJQ0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PigbQ9JJQ0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PigbQ9JJQ0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PigbQ9JJQ0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PigbQ9JJQ0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PigbQ9JJQ0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PigbQ9JJQ0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PigbQ9JJQ0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PigbQ9JJQ0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PigbQ9JJQ0 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PigbQ9JJQ0 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PigbQ9JJQ0 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PigbQ9JJQ0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PigbQ9JJQ0 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PigbQ9JJQ0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PigbQ9JJQ0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PigbQ9JJQ0 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PigbQ9JJQ0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PigbQ9JJQ0 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PigbQ9JJQ0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PigbQ9JJQ0 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PigbQ9JJQ0 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PigbQ9JJQ0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PigbQ9JJQ0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PigbQ9JJQ0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PigbQ9JJQ0 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PigbQ9JJQ0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PigbQ9JJQ0 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PigbQ9JJQ0 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PigbQ9JJQ0 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PigbQ9JJQ0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PigbQ9JJQ0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PigbQ9JJQ0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PigbQ9JJQ0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PigbQ9JJQ0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PigbQ9JJQ0 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PigbQ9JJQ0 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PigbQ9JJQ0 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PigbQ9JJQ0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PigbQ9JJQ0 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PigbQ9JJQ0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PigbQ9JJQ0 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PigbQ9JJQ0 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PigbQ9JJQ0 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PigbQ9JJQ0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms