Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN6

Ctnnbip1, Beta-catenin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbip1Q9JJN6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ctnnbip1Q9JJN6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ctnnbip1Q9JJN6 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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