Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Riox1Q9JJF3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Riox1Q9JJF3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms