Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RabggtaQ9JHK4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RabggtaQ9JHK4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RabggtaQ9JHK4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RabggtaQ9JHK4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RabggtaQ9JHK4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RabggtaQ9JHK4 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RabggtaQ9JHK4 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RabggtaQ9JHK4 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RabggtaQ9JHK4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RabggtaQ9JHK4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RabggtaQ9JHK4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RabggtaQ9JHK4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RabggtaQ9JHK4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RabggtaQ9JHK4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RabggtaQ9JHK4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RabggtaQ9JHK4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RabggtaQ9JHK4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RabggtaQ9JHK4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RabggtaQ9JHK4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RabggtaQ9JHK4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RabggtaQ9JHK4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RabggtaQ9JHK4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RabggtaQ9JHK4 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RabggtaQ9JHK4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RabggtaQ9JHK4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RabggtaQ9JHK4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RabggtaQ9JHK4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RabggtaQ9JHK4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RabggtaQ9JHK4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RabggtaQ9JHK4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RabggtaQ9JHK4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RabggtaQ9JHK4 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RabggtaQ9JHK4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RabggtaQ9JHK4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RabggtaQ9JHK4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RabggtaQ9JHK4 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RabggtaQ9JHK4 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RabggtaQ9JHK4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RabggtaQ9JHK4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RabggtaQ9JHK4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RabggtaQ9JHK4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RabggtaQ9JHK4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RabggtaQ9JHK4 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RabggtaQ9JHK4 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RabggtaQ9JHK4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RabggtaQ9JHK4 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
RabggtaQ9JHK4 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RabggtaQ9JHK4 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RabggtaQ9JHK4 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RabggtaQ9JHK4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RabggtaQ9JHK4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RabggtaQ9JHK4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RabggtaQ9JHK4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RabggtaQ9JHK4 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RabggtaQ9JHK4 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RabggtaQ9JHK4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RabggtaQ9JHK4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RabggtaQ9JHK4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RabggtaQ9JHK4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RabggtaQ9JHK4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RabggtaQ9JHK4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RabggtaQ9JHK4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RabggtaQ9JHK4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RabggtaQ9JHK4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RabggtaQ9JHK4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RabggtaQ9JHK4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RabggtaQ9JHK4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RabggtaQ9JHK4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RabggtaQ9JHK4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
RabggtaQ9JHK4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RabggtaQ9JHK4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RabggtaQ9JHK4 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RabggtaQ9JHK4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RabggtaQ9JHK4 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RabggtaQ9JHK4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RabggtaQ9JHK4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RabggtaQ9JHK4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RabggtaQ9JHK4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RabggtaQ9JHK4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RabggtaQ9JHK4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RabggtaQ9JHK4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RabggtaQ9JHK4 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
RabggtaQ9JHK4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RabggtaQ9JHK4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RabggtaQ9JHK4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RabggtaQ9JHK4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RabggtaQ9JHK4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RabggtaQ9JHK4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RabggtaQ9JHK4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RabggtaQ9JHK4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RabggtaQ9JHK4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RabggtaQ9JHK4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
RabggtaQ9JHK4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RabggtaQ9JHK4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RabggtaQ9JHK4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RabggtaQ9JHK4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RabggtaQ9JHK4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RabggtaQ9JHK4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RabggtaQ9JHK4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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