Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHI7

Exosc9, Exosome complex component RRP45, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc9Q9JHI7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Exosc9Q9JHI7 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Exosc9Q9JHI7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Exosc9Q9JHI7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Exosc9Q9JHI7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Exosc9Q9JHI7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Exosc9Q9JHI7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Exosc9Q9JHI7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Exosc9Q9JHI7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Exosc9Q9JHI7 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Exosc9Q9JHI7 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Exosc9Q9JHI7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Exosc9Q9JHI7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Exosc9Q9JHI7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Exosc9Q9JHI7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Exosc9Q9JHI7 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Exosc9Q9JHI7 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Exosc9Q9JHI7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Exosc9Q9JHI7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Exosc9Q9JHI7 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Exosc9Q9JHI7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Exosc9Q9JHI7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Exosc9Q9JHI7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Exosc9Q9JHI7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Exosc9Q9JHI7 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Exosc9Q9JHI7 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Exosc9Q9JHI7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Exosc9Q9JHI7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Exosc9Q9JHI7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Exosc9Q9JHI7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Exosc9Q9JHI7 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Exosc9Q9JHI7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Exosc9Q9JHI7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Exosc9Q9JHI7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Exosc9Q9JHI7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Exosc9Q9JHI7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Exosc9Q9JHI7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Exosc9Q9JHI7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Exosc9Q9JHI7 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Exosc9Q9JHI7 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Exosc9Q9JHI7 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Exosc9Q9JHI7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Exosc9Q9JHI7 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Exosc9Q9JHI7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Exosc9Q9JHI7 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Exosc9Q9JHI7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Exosc9Q9JHI7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Exosc9Q9JHI7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Exosc9Q9JHI7 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Exosc9Q9JHI7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Exosc9Q9JHI7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Exosc9Q9JHI7 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Exosc9Q9JHI7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Exosc9Q9JHI7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Exosc9Q9JHI7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Exosc9Q9JHI7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Exosc9Q9JHI7 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Exosc9Q9JHI7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Exosc9Q9JHI7 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Exosc9Q9JHI7 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Exosc9Q9JHI7 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Exosc9Q9JHI7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Exosc9Q9JHI7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Exosc9Q9JHI7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Exosc9Q9JHI7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Exosc9Q9JHI7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Exosc9Q9JHI7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Exosc9Q9JHI7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Exosc9Q9JHI7 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Exosc9Q9JHI7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Exosc9Q9JHI7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Exosc9Q9JHI7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Exosc9Q9JHI7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Exosc9Q9JHI7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Exosc9Q9JHI7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Exosc9Q9JHI7 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Exosc9Q9JHI7 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Exosc9Q9JHI7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Exosc9Q9JHI7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Exosc9Q9JHI7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Exosc9Q9JHI7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Exosc9Q9JHI7 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Exosc9Q9JHI7 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Exosc9Q9JHI7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Exosc9Q9JHI7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Exosc9Q9JHI7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Exosc9Q9JHI7 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Exosc9Q9JHI7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Exosc9Q9JHI7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Exosc9Q9JHI7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Exosc9Q9JHI7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Exosc9Q9JHI7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Exosc9Q9JHI7 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Exosc9Q9JHI7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Exosc9Q9JHI7 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Exosc9Q9JHI7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Exosc9Q9JHI7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Exosc9Q9JHI7 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Exosc9Q9JHI7 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Exosc9Q9JHI7 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms