Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Tcirg1Q9JHF5 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tcirg1Q9JHF5 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Tcirg1Q9JHF5 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Tcirg1Q9JHF5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tcirg1Q9JHF5 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tcirg1Q9JHF5 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tcirg1Q9JHF5 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tcirg1Q9JHF5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tcirg1Q9JHF5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tcirg1Q9JHF5 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tcirg1Q9JHF5 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tcirg1Q9JHF5 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tcirg1Q9JHF5 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tcirg1Q9JHF5 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tcirg1Q9JHF5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tcirg1Q9JHF5 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tcirg1Q9JHF5 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tcirg1Q9JHF5 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tcirg1Q9JHF5 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Tcirg1Q9JHF5 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tcirg1Q9JHF5 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Tcirg1Q9JHF5 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tcirg1Q9JHF5 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tcirg1Q9JHF5 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tcirg1Q9JHF5 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tcirg1Q9JHF5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tcirg1Q9JHF5 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tcirg1Q9JHF5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tcirg1Q9JHF5 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tcirg1Q9JHF5 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tcirg1Q9JHF5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tcirg1Q9JHF5 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tcirg1Q9JHF5 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tcirg1Q9JHF5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tcirg1Q9JHF5 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tcirg1Q9JHF5 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tcirg1Q9JHF5 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms