Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ47

Vmn1r44, Vomeronasal type-1 receptor 44, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r44Q9EQ47 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r44Q9EQ47 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r44Q9EQ47 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Vmn1r44Q9EQ47 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
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Vmn1r44Q9EQ47 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Vmn1r44Q9EQ47 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Vmn1r44Q9EQ47 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r44Q9EQ47 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
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Vmn1r44Q9EQ47 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Vmn1r44Q9EQ47 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Vmn1r44Q9EQ47 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Vmn1r44Q9EQ47 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Vmn1r44Q9EQ47 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r44Q9EQ47 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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Vmn1r44Q9EQ47 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Vmn1r44Q9EQ47 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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