Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

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Length 795 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tlr1Q9EPQ1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tlr1Q9EPQ1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr1Q9EPQ1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr1Q9EPQ1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr1Q9EPQ1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr1Q9EPQ1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr1Q9EPQ1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr1Q9EPQ1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr1Q9EPQ1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr1Q9EPQ1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr1Q9EPQ1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr1Q9EPQ1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr1Q9EPQ1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr1Q9EPQ1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr1Q9EPQ1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr1Q9EPQ1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr1Q9EPQ1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr1Q9EPQ1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr1Q9EPQ1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr1Q9EPQ1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr1Q9EPQ1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr1Q9EPQ1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr1Q9EPQ1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tlr1Q9EPQ1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tlr1Q9EPQ1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tlr1Q9EPQ1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tlr1Q9EPQ1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tlr1Q9EPQ1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tlr1Q9EPQ1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tlr1Q9EPQ1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tlr1Q9EPQ1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tlr1Q9EPQ1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tlr1Q9EPQ1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tlr1Q9EPQ1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tlr1Q9EPQ1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tlr1Q9EPQ1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tlr1Q9EPQ1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tlr1Q9EPQ1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tlr1Q9EPQ1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tlr1Q9EPQ1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tlr1Q9EPQ1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlr1Q9EPQ1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlr1Q9EPQ1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlr1Q9EPQ1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlr1Q9EPQ1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlr1Q9EPQ1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlr1Q9EPQ1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlr1Q9EPQ1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlr1Q9EPQ1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlr1Q9EPQ1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlr1Q9EPQ1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlr1Q9EPQ1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlr1Q9EPQ1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlr1Q9EPQ1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlr1Q9EPQ1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlr1Q9EPQ1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlr1Q9EPQ1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlr1Q9EPQ1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlr1Q9EPQ1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlr1Q9EPQ1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlr1Q9EPQ1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlr1Q9EPQ1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlr1Q9EPQ1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlr1Q9EPQ1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlr1Q9EPQ1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlr1Q9EPQ1 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlr1Q9EPQ1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlr1Q9EPQ1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlr1Q9EPQ1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlr1Q9EPQ1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlr1Q9EPQ1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlr1Q9EPQ1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlr1Q9EPQ1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tlr1Q9EPQ1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tlr1Q9EPQ1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tlr1Q9EPQ1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tlr1Q9EPQ1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tlr1Q9EPQ1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tlr1Q9EPQ1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tlr1Q9EPQ1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tlr1Q9EPQ1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tlr1Q9EPQ1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tlr1Q9EPQ1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tlr1Q9EPQ1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tlr1Q9EPQ1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tlr1Q9EPQ1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tlr1Q9EPQ1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tlr1Q9EPQ1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tlr1Q9EPQ1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tlr1Q9EPQ1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tlr1Q9EPQ1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tlr1Q9EPQ1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tlr1Q9EPQ1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tlr1Q9EPQ1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tlr1Q9EPQ1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tlr1Q9EPQ1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tlr1Q9EPQ1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tlr1Q9EPQ1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tlr1Q9EPQ1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms