Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc89Q9DA73 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc89Q9DA73 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc89Q9DA73 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc89Q9DA73 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc89Q9DA73 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc89Q9DA73 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc89Q9DA73 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc89Q9DA73 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc89Q9DA73 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc89Q9DA73 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc89Q9DA73 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc89Q9DA73 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc89Q9DA73 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc89Q9DA73 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc89Q9DA73 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc89Q9DA73 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc89Q9DA73 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc89Q9DA73 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc89Q9DA73 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc89Q9DA73 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc89Q9DA73 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc89Q9DA73 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc89Q9DA73 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc89Q9DA73 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc89Q9DA73 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc89Q9DA73 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc89Q9DA73 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc89Q9DA73 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc89Q9DA73 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc89Q9DA73 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc89Q9DA73 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc89Q9DA73 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc89Q9DA73 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc89Q9DA73 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc89Q9DA73 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc89Q9DA73 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc89Q9DA73 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc89Q9DA73 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc89Q9DA73 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc89Q9DA73 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc89Q9DA73 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc89Q9DA73 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc89Q9DA73 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc89Q9DA73 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc89Q9DA73 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc89Q9DA73 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc89Q9DA73 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc89Q9DA73 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc89Q9DA73 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc89Q9DA73 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc89Q9DA73 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc89Q9DA73 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc89Q9DA73 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc89Q9DA73 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc89Q9DA73 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc89Q9DA73 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc89Q9DA73 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc89Q9DA73 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc89Q9DA73 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc89Q9DA73 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc89Q9DA73 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc89Q9DA73 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc89Q9DA73 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc89Q9DA73 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc89Q9DA73 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc89Q9DA73 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc89Q9DA73 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc89Q9DA73 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc89Q9DA73 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc89Q9DA73 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc89Q9DA73 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc89Q9DA73 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc89Q9DA73 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc89Q9DA73 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc89Q9DA73 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc89Q9DA73 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc89Q9DA73 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc89Q9DA73 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc89Q9DA73 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc89Q9DA73 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc89Q9DA73 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc89Q9DA73 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc89Q9DA73 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc89Q9DA73 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc89Q9DA73 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc89Q9DA73 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc89Q9DA73 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc89Q9DA73 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc89Q9DA73 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc89Q9DA73 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc89Q9DA73 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc89Q9DA73 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc89Q9DA73 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc89Q9DA73 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc89Q9DA73 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc89Q9DA73 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc89Q9DA73 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc89Q9DA73 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc89Q9DA73 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms