Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
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Usp12Q9D9M2 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
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Usp12Q9D9M2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp12Q9D9M2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
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