Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J3

Actrt1, Actin-related protein T1, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt1Q9D9J3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Actrt1Q9D9J3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Actrt1Q9D9J3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Actrt1Q9D9J3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Actrt1Q9D9J3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Actrt1Q9D9J3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Actrt1Q9D9J3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Actrt1Q9D9J3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Actrt1Q9D9J3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Actrt1Q9D9J3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Actrt1Q9D9J3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Actrt1Q9D9J3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Actrt1Q9D9J3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Actrt1Q9D9J3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Actrt1Q9D9J3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Actrt1Q9D9J3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Actrt1Q9D9J3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Actrt1Q9D9J3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Actrt1Q9D9J3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Actrt1Q9D9J3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Actrt1Q9D9J3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Actrt1Q9D9J3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Actrt1Q9D9J3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Actrt1Q9D9J3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Actrt1Q9D9J3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Actrt1Q9D9J3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Actrt1Q9D9J3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Actrt1Q9D9J3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Actrt1Q9D9J3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Actrt1Q9D9J3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actrt1Q9D9J3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actrt1Q9D9J3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actrt1Q9D9J3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actrt1Q9D9J3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actrt1Q9D9J3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actrt1Q9D9J3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actrt1Q9D9J3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actrt1Q9D9J3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Actrt1Q9D9J3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actrt1Q9D9J3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actrt1Q9D9J3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actrt1Q9D9J3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actrt1Q9D9J3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actrt1Q9D9J3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actrt1Q9D9J3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actrt1Q9D9J3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Actrt1Q9D9J3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Actrt1Q9D9J3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Actrt1Q9D9J3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Actrt1Q9D9J3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Actrt1Q9D9J3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Actrt1Q9D9J3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Actrt1Q9D9J3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Actrt1Q9D9J3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Actrt1Q9D9J3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Actrt1Q9D9J3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Actrt1Q9D9J3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Actrt1Q9D9J3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actrt1Q9D9J3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actrt1Q9D9J3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actrt1Q9D9J3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actrt1Q9D9J3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actrt1Q9D9J3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actrt1Q9D9J3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actrt1Q9D9J3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actrt1Q9D9J3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actrt1Q9D9J3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actrt1Q9D9J3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actrt1Q9D9J3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actrt1Q9D9J3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actrt1Q9D9J3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actrt1Q9D9J3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actrt1Q9D9J3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actrt1Q9D9J3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actrt1Q9D9J3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Actrt1Q9D9J3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Actrt1Q9D9J3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Actrt1Q9D9J3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Actrt1Q9D9J3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Actrt1Q9D9J3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Actrt1Q9D9J3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Actrt1Q9D9J3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Actrt1Q9D9J3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Actrt1Q9D9J3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Actrt1Q9D9J3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Actrt1Q9D9J3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms