Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T4

Tvp23b, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23bQ9D8T4 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tvp23bQ9D8T4 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tvp23bQ9D8T4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms