Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chmp5Q9D7S9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chmp5Q9D7S9 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Chmp5Q9D7S9 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chmp5Q9D7S9 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chmp5Q9D7S9 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chmp5Q9D7S9 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chmp5Q9D7S9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chmp5Q9D7S9 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Chmp5Q9D7S9 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chmp5Q9D7S9 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chmp5Q9D7S9 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chmp5Q9D7S9 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chmp5Q9D7S9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chmp5Q9D7S9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chmp5Q9D7S9 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chmp5Q9D7S9 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chmp5Q9D7S9 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chmp5Q9D7S9 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chmp5Q9D7S9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chmp5Q9D7S9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chmp5Q9D7S9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chmp5Q9D7S9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chmp5Q9D7S9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chmp5Q9D7S9 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chmp5Q9D7S9 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chmp5Q9D7S9 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chmp5Q9D7S9 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chmp5Q9D7S9 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chmp5Q9D7S9 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chmp5Q9D7S9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chmp5Q9D7S9 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chmp5Q9D7S9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chmp5Q9D7S9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chmp5Q9D7S9 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chmp5Q9D7S9 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chmp5Q9D7S9 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chmp5Q9D7S9 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Chmp5Q9D7S9 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chmp5Q9D7S9 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chmp5Q9D7S9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chmp5Q9D7S9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chmp5Q9D7S9 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chmp5Q9D7S9 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chmp5Q9D7S9 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chmp5Q9D7S9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chmp5Q9D7S9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chmp5Q9D7S9 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chmp5Q9D7S9 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chmp5Q9D7S9 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chmp5Q9D7S9 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chmp5Q9D7S9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chmp5Q9D7S9 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chmp5Q9D7S9 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chmp5Q9D7S9 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chmp5Q9D7S9 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chmp5Q9D7S9 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chmp5Q9D7S9 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chmp5Q9D7S9 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chmp5Q9D7S9 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Chmp5Q9D7S9 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chmp5Q9D7S9 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chmp5Q9D7S9 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chmp5Q9D7S9 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chmp5Q9D7S9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chmp5Q9D7S9 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chmp5Q9D7S9 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chmp5Q9D7S9 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chmp5Q9D7S9 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chmp5Q9D7S9 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chmp5Q9D7S9 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chmp5Q9D7S9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chmp5Q9D7S9 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chmp5Q9D7S9 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chmp5Q9D7S9 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chmp5Q9D7S9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chmp5Q9D7S9 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Chmp5Q9D7S9 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chmp5Q9D7S9 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chmp5Q9D7S9 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chmp5Q9D7S9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chmp5Q9D7S9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chmp5Q9D7S9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chmp5Q9D7S9 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chmp5Q9D7S9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chmp5Q9D7S9 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chmp5Q9D7S9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chmp5Q9D7S9 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chmp5Q9D7S9 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chmp5Q9D7S9 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chmp5Q9D7S9 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chmp5Q9D7S9 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chmp5Q9D7S9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chmp5Q9D7S9 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chmp5Q9D7S9 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chmp5Q9D7S9 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chmp5Q9D7S9 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chmp5Q9D7S9 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chmp5Q9D7S9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chmp5Q9D7S9 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms