Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7R7

Pgc, Gastricsin, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PgcQ9D7R7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PgcQ9D7R7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PgcQ9D7R7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PgcQ9D7R7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PgcQ9D7R7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PgcQ9D7R7 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PgcQ9D7R7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PgcQ9D7R7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PgcQ9D7R7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PgcQ9D7R7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PgcQ9D7R7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PgcQ9D7R7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PgcQ9D7R7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PgcQ9D7R7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PgcQ9D7R7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PgcQ9D7R7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PgcQ9D7R7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PgcQ9D7R7 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PgcQ9D7R7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PgcQ9D7R7 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PgcQ9D7R7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PgcQ9D7R7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PgcQ9D7R7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PgcQ9D7R7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PgcQ9D7R7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PgcQ9D7R7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PgcQ9D7R7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PgcQ9D7R7 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PgcQ9D7R7 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PgcQ9D7R7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PgcQ9D7R7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PgcQ9D7R7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PgcQ9D7R7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PgcQ9D7R7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PgcQ9D7R7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PgcQ9D7R7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PgcQ9D7R7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PgcQ9D7R7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PgcQ9D7R7 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PgcQ9D7R7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PgcQ9D7R7 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PgcQ9D7R7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PgcQ9D7R7 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PgcQ9D7R7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PgcQ9D7R7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PgcQ9D7R7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PgcQ9D7R7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PgcQ9D7R7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PgcQ9D7R7 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PgcQ9D7R7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PgcQ9D7R7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PgcQ9D7R7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PgcQ9D7R7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PgcQ9D7R7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PgcQ9D7R7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PgcQ9D7R7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PgcQ9D7R7 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PgcQ9D7R7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PgcQ9D7R7 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PgcQ9D7R7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PgcQ9D7R7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PgcQ9D7R7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PgcQ9D7R7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PgcQ9D7R7 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PgcQ9D7R7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PgcQ9D7R7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PgcQ9D7R7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PgcQ9D7R7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PgcQ9D7R7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PgcQ9D7R7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PgcQ9D7R7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PgcQ9D7R7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PgcQ9D7R7 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PgcQ9D7R7 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PgcQ9D7R7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PgcQ9D7R7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PgcQ9D7R7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PgcQ9D7R7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PgcQ9D7R7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PgcQ9D7R7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PgcQ9D7R7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PgcQ9D7R7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PgcQ9D7R7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PgcQ9D7R7 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PgcQ9D7R7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PgcQ9D7R7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PgcQ9D7R7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PgcQ9D7R7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PgcQ9D7R7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PgcQ9D7R7 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PgcQ9D7R7 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PgcQ9D7R7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PgcQ9D7R7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PgcQ9D7R7 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PgcQ9D7R7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PgcQ9D7R7 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PgcQ9D7R7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PgcQ9D7R7 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PgcQ9D7R7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PgcQ9D7R7 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms