Protein–RNA interactions for Protein: Q9D777

Tnfsf13, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13Q9D777 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfsf13Q9D777 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnfsf13Q9D777 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms