Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6G9

Cmtm5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm5Q9D6G9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cmtm5Q9D6G9 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cmtm5Q9D6G9 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cmtm5Q9D6G9 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cmtm5Q9D6G9 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cmtm5Q9D6G9 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cmtm5Q9D6G9 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cmtm5Q9D6G9 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cmtm5Q9D6G9 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cmtm5Q9D6G9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cmtm5Q9D6G9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cmtm5Q9D6G9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cmtm5Q9D6G9 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cmtm5Q9D6G9 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cmtm5Q9D6G9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cmtm5Q9D6G9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cmtm5Q9D6G9 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cmtm5Q9D6G9 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Cmtm5Q9D6G9 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cmtm5Q9D6G9 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cmtm5Q9D6G9 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cmtm5Q9D6G9 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Cmtm5Q9D6G9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cmtm5Q9D6G9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cmtm5Q9D6G9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cmtm5Q9D6G9 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cmtm5Q9D6G9 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cmtm5Q9D6G9 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cmtm5Q9D6G9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cmtm5Q9D6G9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cmtm5Q9D6G9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cmtm5Q9D6G9 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cmtm5Q9D6G9 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cmtm5Q9D6G9 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cmtm5Q9D6G9 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Cmtm5Q9D6G9 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cmtm5Q9D6G9 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cmtm5Q9D6G9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cmtm5Q9D6G9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cmtm5Q9D6G9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Cmtm5Q9D6G9 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cmtm5Q9D6G9 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cmtm5Q9D6G9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cmtm5Q9D6G9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cmtm5Q9D6G9 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cmtm5Q9D6G9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cmtm5Q9D6G9 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cmtm5Q9D6G9 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cmtm5Q9D6G9 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cmtm5Q9D6G9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cmtm5Q9D6G9 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cmtm5Q9D6G9 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cmtm5Q9D6G9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Cmtm5Q9D6G9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cmtm5Q9D6G9 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cmtm5Q9D6G9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cmtm5Q9D6G9 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cmtm5Q9D6G9 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cmtm5Q9D6G9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cmtm5Q9D6G9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cmtm5Q9D6G9 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cmtm5Q9D6G9 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cmtm5Q9D6G9 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cmtm5Q9D6G9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cmtm5Q9D6G9 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cmtm5Q9D6G9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cmtm5Q9D6G9 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cmtm5Q9D6G9 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Cmtm5Q9D6G9 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cmtm5Q9D6G9 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cmtm5Q9D6G9 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cmtm5Q9D6G9 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cmtm5Q9D6G9 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cmtm5Q9D6G9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cmtm5Q9D6G9 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cmtm5Q9D6G9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cmtm5Q9D6G9 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cmtm5Q9D6G9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cmtm5Q9D6G9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cmtm5Q9D6G9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cmtm5Q9D6G9 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cmtm5Q9D6G9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cmtm5Q9D6G9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cmtm5Q9D6G9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cmtm5Q9D6G9 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cmtm5Q9D6G9 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Cmtm5Q9D6G9 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Cmtm5Q9D6G9 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Cmtm5Q9D6G9 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Cmtm5Q9D6G9 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Cmtm5Q9D6G9 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Cmtm5Q9D6G9 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cmtm5Q9D6G9 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cmtm5Q9D6G9 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cmtm5Q9D6G9 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cmtm5Q9D6G9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cmtm5Q9D6G9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cmtm5Q9D6G9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cmtm5Q9D6G9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cmtm5Q9D6G9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms