Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5L7

Spsb1, SPRY domain-containing SOCS box protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spsb1Q9D5L7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spsb1Q9D5L7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spsb1Q9D5L7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spsb1Q9D5L7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spsb1Q9D5L7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spsb1Q9D5L7 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spsb1Q9D5L7 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spsb1Q9D5L7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spsb1Q9D5L7 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spsb1Q9D5L7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spsb1Q9D5L7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Spsb1Q9D5L7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spsb1Q9D5L7 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spsb1Q9D5L7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spsb1Q9D5L7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spsb1Q9D5L7 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spsb1Q9D5L7 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spsb1Q9D5L7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spsb1Q9D5L7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spsb1Q9D5L7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spsb1Q9D5L7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spsb1Q9D5L7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spsb1Q9D5L7 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spsb1Q9D5L7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spsb1Q9D5L7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spsb1Q9D5L7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spsb1Q9D5L7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spsb1Q9D5L7 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spsb1Q9D5L7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spsb1Q9D5L7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spsb1Q9D5L7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spsb1Q9D5L7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spsb1Q9D5L7 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spsb1Q9D5L7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spsb1Q9D5L7 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spsb1Q9D5L7 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spsb1Q9D5L7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spsb1Q9D5L7 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spsb1Q9D5L7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spsb1Q9D5L7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spsb1Q9D5L7 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spsb1Q9D5L7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spsb1Q9D5L7 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spsb1Q9D5L7 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spsb1Q9D5L7 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Spsb1Q9D5L7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spsb1Q9D5L7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spsb1Q9D5L7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spsb1Q9D5L7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spsb1Q9D5L7 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spsb1Q9D5L7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spsb1Q9D5L7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spsb1Q9D5L7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spsb1Q9D5L7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spsb1Q9D5L7 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spsb1Q9D5L7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Spsb1Q9D5L7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spsb1Q9D5L7 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spsb1Q9D5L7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spsb1Q9D5L7 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spsb1Q9D5L7 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spsb1Q9D5L7 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spsb1Q9D5L7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spsb1Q9D5L7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spsb1Q9D5L7 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spsb1Q9D5L7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spsb1Q9D5L7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spsb1Q9D5L7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Spsb1Q9D5L7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spsb1Q9D5L7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spsb1Q9D5L7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spsb1Q9D5L7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spsb1Q9D5L7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Spsb1Q9D5L7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Spsb1Q9D5L7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Spsb1Q9D5L7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Spsb1Q9D5L7 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Spsb1Q9D5L7 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spsb1Q9D5L7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spsb1Q9D5L7 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spsb1Q9D5L7 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spsb1Q9D5L7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spsb1Q9D5L7 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spsb1Q9D5L7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spsb1Q9D5L7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spsb1Q9D5L7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Spsb1Q9D5L7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Spsb1Q9D5L7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spsb1Q9D5L7 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spsb1Q9D5L7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spsb1Q9D5L7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spsb1Q9D5L7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spsb1Q9D5L7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spsb1Q9D5L7 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spsb1Q9D5L7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spsb1Q9D5L7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spsb1Q9D5L7 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spsb1Q9D5L7 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spsb1Q9D5L7 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spsb1Q9D5L7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms