Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q4

4930578G10Rik, RIKEN cDNA 4930578G10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930578G10RikQ9D4Q4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930578G10RikQ9D4Q4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930578G10RikQ9D4Q4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930578G10RikQ9D4Q4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930578G10RikQ9D4Q4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930578G10RikQ9D4Q4 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930578G10RikQ9D4Q4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930578G10RikQ9D4Q4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930578G10RikQ9D4Q4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930578G10RikQ9D4Q4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930578G10RikQ9D4Q4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
4930578G10RikQ9D4Q4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930578G10RikQ9D4Q4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
4930578G10RikQ9D4Q4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930578G10RikQ9D4Q4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930578G10RikQ9D4Q4 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930578G10RikQ9D4Q4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930578G10RikQ9D4Q4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930578G10RikQ9D4Q4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930578G10RikQ9D4Q4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930578G10RikQ9D4Q4 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930578G10RikQ9D4Q4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930578G10RikQ9D4Q4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930578G10RikQ9D4Q4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930578G10RikQ9D4Q4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930578G10RikQ9D4Q4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930578G10RikQ9D4Q4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930578G10RikQ9D4Q4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930578G10RikQ9D4Q4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930578G10RikQ9D4Q4 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930578G10RikQ9D4Q4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930578G10RikQ9D4Q4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930578G10RikQ9D4Q4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930578G10RikQ9D4Q4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930578G10RikQ9D4Q4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930578G10RikQ9D4Q4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930578G10RikQ9D4Q4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930578G10RikQ9D4Q4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930578G10RikQ9D4Q4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930578G10RikQ9D4Q4 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930578G10RikQ9D4Q4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930578G10RikQ9D4Q4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930578G10RikQ9D4Q4 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
4930578G10RikQ9D4Q4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930578G10RikQ9D4Q4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930578G10RikQ9D4Q4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930578G10RikQ9D4Q4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930578G10RikQ9D4Q4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930578G10RikQ9D4Q4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930578G10RikQ9D4Q4 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930578G10RikQ9D4Q4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930578G10RikQ9D4Q4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930578G10RikQ9D4Q4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930578G10RikQ9D4Q4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930578G10RikQ9D4Q4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930578G10RikQ9D4Q4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930578G10RikQ9D4Q4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930578G10RikQ9D4Q4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930578G10RikQ9D4Q4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930578G10RikQ9D4Q4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930578G10RikQ9D4Q4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930578G10RikQ9D4Q4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930578G10RikQ9D4Q4 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930578G10RikQ9D4Q4 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930578G10RikQ9D4Q4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930578G10RikQ9D4Q4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930578G10RikQ9D4Q4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930578G10RikQ9D4Q4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
4930578G10RikQ9D4Q4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
4930578G10RikQ9D4Q4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930578G10RikQ9D4Q4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930578G10RikQ9D4Q4 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930578G10RikQ9D4Q4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930578G10RikQ9D4Q4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930578G10RikQ9D4Q4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930578G10RikQ9D4Q4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930578G10RikQ9D4Q4 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930578G10RikQ9D4Q4 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930578G10RikQ9D4Q4 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930578G10RikQ9D4Q4 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
4930578G10RikQ9D4Q4 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930578G10RikQ9D4Q4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930578G10RikQ9D4Q4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930578G10RikQ9D4Q4 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
4930578G10RikQ9D4Q4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930578G10RikQ9D4Q4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930578G10RikQ9D4Q4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930578G10RikQ9D4Q4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930578G10RikQ9D4Q4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930578G10RikQ9D4Q4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4930578G10RikQ9D4Q4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4930578G10RikQ9D4Q4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
4930578G10RikQ9D4Q4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms