Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3E6

Stag1, Cohesin subunit SA-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag1Q9D3E6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stag1Q9D3E6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stag1Q9D3E6 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stag1Q9D3E6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stag1Q9D3E6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stag1Q9D3E6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stag1Q9D3E6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stag1Q9D3E6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stag1Q9D3E6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stag1Q9D3E6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stag1Q9D3E6 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stag1Q9D3E6 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stag1Q9D3E6 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stag1Q9D3E6 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stag1Q9D3E6 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stag1Q9D3E6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stag1Q9D3E6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stag1Q9D3E6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stag1Q9D3E6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stag1Q9D3E6 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stag1Q9D3E6 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stag1Q9D3E6 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Stag1Q9D3E6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stag1Q9D3E6 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stag1Q9D3E6 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stag1Q9D3E6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stag1Q9D3E6 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stag1Q9D3E6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stag1Q9D3E6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stag1Q9D3E6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stag1Q9D3E6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stag1Q9D3E6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stag1Q9D3E6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stag1Q9D3E6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stag1Q9D3E6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stag1Q9D3E6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stag1Q9D3E6 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stag1Q9D3E6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stag1Q9D3E6 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stag1Q9D3E6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Stag1Q9D3E6 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stag1Q9D3E6 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stag1Q9D3E6 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stag1Q9D3E6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stag1Q9D3E6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stag1Q9D3E6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stag1Q9D3E6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stag1Q9D3E6 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stag1Q9D3E6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Stag1Q9D3E6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Stag1Q9D3E6 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Stag1Q9D3E6 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Stag1Q9D3E6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Stag1Q9D3E6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Stag1Q9D3E6 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Stag1Q9D3E6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Stag1Q9D3E6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Stag1Q9D3E6 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Stag1Q9D3E6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Stag1Q9D3E6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Stag1Q9D3E6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Stag1Q9D3E6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Stag1Q9D3E6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Stag1Q9D3E6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stag1Q9D3E6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stag1Q9D3E6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Stag1Q9D3E6 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stag1Q9D3E6 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Stag1Q9D3E6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stag1Q9D3E6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stag1Q9D3E6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stag1Q9D3E6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stag1Q9D3E6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stag1Q9D3E6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stag1Q9D3E6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stag1Q9D3E6 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stag1Q9D3E6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Stag1Q9D3E6 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Stag1Q9D3E6 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Stag1Q9D3E6 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Stag1Q9D3E6 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Stag1Q9D3E6 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Stag1Q9D3E6 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Stag1Q9D3E6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Stag1Q9D3E6 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Stag1Q9D3E6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Stag1Q9D3E6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Stag1Q9D3E6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Stag1Q9D3E6 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Stag1Q9D3E6 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Stag1Q9D3E6 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Stag1Q9D3E6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Stag1Q9D3E6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Stag1Q9D3E6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Stag1Q9D3E6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Stag1Q9D3E6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Stag1Q9D3E6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Stag1Q9D3E6 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Stag1Q9D3E6 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Stag1Q9D3E6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms