Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1L0

Chchd2, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd2Q9D1L0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chchd2Q9D1L0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chchd2Q9D1L0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chchd2Q9D1L0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chchd2Q9D1L0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chchd2Q9D1L0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chchd2Q9D1L0 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Chchd2Q9D1L0 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chchd2Q9D1L0 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Chchd2Q9D1L0 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Chchd2Q9D1L0 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Chchd2Q9D1L0 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chchd2Q9D1L0 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chchd2Q9D1L0 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chchd2Q9D1L0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chchd2Q9D1L0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chchd2Q9D1L0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chchd2Q9D1L0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chchd2Q9D1L0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chchd2Q9D1L0 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chchd2Q9D1L0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chchd2Q9D1L0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chchd2Q9D1L0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chchd2Q9D1L0 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chchd2Q9D1L0 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chchd2Q9D1L0 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chchd2Q9D1L0 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chchd2Q9D1L0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chchd2Q9D1L0 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chchd2Q9D1L0 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chchd2Q9D1L0 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chchd2Q9D1L0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chchd2Q9D1L0 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chchd2Q9D1L0 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chchd2Q9D1L0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chchd2Q9D1L0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chchd2Q9D1L0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chchd2Q9D1L0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chchd2Q9D1L0 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chchd2Q9D1L0 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chchd2Q9D1L0 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chchd2Q9D1L0 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Chchd2Q9D1L0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chchd2Q9D1L0 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chchd2Q9D1L0 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chchd2Q9D1L0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Chchd2Q9D1L0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chchd2Q9D1L0 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chchd2Q9D1L0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chchd2Q9D1L0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chchd2Q9D1L0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chchd2Q9D1L0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Chchd2Q9D1L0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chchd2Q9D1L0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chchd2Q9D1L0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chchd2Q9D1L0 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chchd2Q9D1L0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Chchd2Q9D1L0 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chchd2Q9D1L0 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chchd2Q9D1L0 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chchd2Q9D1L0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chchd2Q9D1L0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Chchd2Q9D1L0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Chchd2Q9D1L0 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chchd2Q9D1L0 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chchd2Q9D1L0 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chchd2Q9D1L0 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chchd2Q9D1L0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chchd2Q9D1L0 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chchd2Q9D1L0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chchd2Q9D1L0 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chchd2Q9D1L0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Chchd2Q9D1L0 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chchd2Q9D1L0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chchd2Q9D1L0 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chchd2Q9D1L0 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chchd2Q9D1L0 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Chchd2Q9D1L0 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chchd2Q9D1L0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chchd2Q9D1L0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chchd2Q9D1L0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chchd2Q9D1L0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chchd2Q9D1L0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chchd2Q9D1L0 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chchd2Q9D1L0 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
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