Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E4

Cysrt1, Cysteine-rich tail protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cysrt1Q9D1E4 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cysrt1Q9D1E4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms