Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gtf2e1Q9D0D5 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gtf2e1Q9D0D5 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gtf2e1Q9D0D5 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gtf2e1Q9D0D5 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gtf2e1Q9D0D5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gtf2e1Q9D0D5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gtf2e1Q9D0D5 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gtf2e1Q9D0D5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gtf2e1Q9D0D5 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gtf2e1Q9D0D5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gtf2e1Q9D0D5 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gtf2e1Q9D0D5 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gtf2e1Q9D0D5 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gtf2e1Q9D0D5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gtf2e1Q9D0D5 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gtf2e1Q9D0D5 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gtf2e1Q9D0D5 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gtf2e1Q9D0D5 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gtf2e1Q9D0D5 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Gtf2e1Q9D0D5 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Gtf2e1Q9D0D5 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gtf2e1Q9D0D5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gtf2e1Q9D0D5 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gtf2e1Q9D0D5 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gtf2e1Q9D0D5 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gtf2e1Q9D0D5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gtf2e1Q9D0D5 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gtf2e1Q9D0D5 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gtf2e1Q9D0D5 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gtf2e1Q9D0D5 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gtf2e1Q9D0D5 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gtf2e1Q9D0D5 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gtf2e1Q9D0D5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gtf2e1Q9D0D5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gtf2e1Q9D0D5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gtf2e1Q9D0D5 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Gtf2e1Q9D0D5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gtf2e1Q9D0D5 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gtf2e1Q9D0D5 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Gtf2e1Q9D0D5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gtf2e1Q9D0D5 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gtf2e1Q9D0D5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gtf2e1Q9D0D5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gtf2e1Q9D0D5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gtf2e1Q9D0D5 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gtf2e1Q9D0D5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gtf2e1Q9D0D5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gtf2e1Q9D0D5 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gtf2e1Q9D0D5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gtf2e1Q9D0D5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gtf2e1Q9D0D5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gtf2e1Q9D0D5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gtf2e1Q9D0D5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gtf2e1Q9D0D5 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gtf2e1Q9D0D5 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gtf2e1Q9D0D5 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gtf2e1Q9D0D5 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gtf2e1Q9D0D5 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Gtf2e1Q9D0D5 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gtf2e1Q9D0D5 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Gtf2e1Q9D0D5 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gtf2e1Q9D0D5 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gtf2e1Q9D0D5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gtf2e1Q9D0D5 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gtf2e1Q9D0D5 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gtf2e1Q9D0D5 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gtf2e1Q9D0D5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gtf2e1Q9D0D5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gtf2e1Q9D0D5 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Gtf2e1Q9D0D5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gtf2e1Q9D0D5 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gtf2e1Q9D0D5 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Gtf2e1Q9D0D5 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gtf2e1Q9D0D5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gtf2e1Q9D0D5 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gtf2e1Q9D0D5 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Gtf2e1Q9D0D5 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gtf2e1Q9D0D5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gtf2e1Q9D0D5 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Gtf2e1Q9D0D5 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gtf2e1Q9D0D5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gtf2e1Q9D0D5 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gtf2e1Q9D0D5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gtf2e1Q9D0D5 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gtf2e1Q9D0D5 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gtf2e1Q9D0D5 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gtf2e1Q9D0D5 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gtf2e1Q9D0D5 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gtf2e1Q9D0D5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gtf2e1Q9D0D5 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gtf2e1Q9D0D5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gtf2e1Q9D0D5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gtf2e1Q9D0D5 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 216.8 ms