Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZD0

Mmachc, Methylmalonic aciduria and homocystinuria type C protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MmachcQ9CZD0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MmachcQ9CZD0 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MmachcQ9CZD0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MmachcQ9CZD0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MmachcQ9CZD0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MmachcQ9CZD0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MmachcQ9CZD0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MmachcQ9CZD0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MmachcQ9CZD0 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MmachcQ9CZD0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MmachcQ9CZD0 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MmachcQ9CZD0 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MmachcQ9CZD0 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MmachcQ9CZD0 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MmachcQ9CZD0 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MmachcQ9CZD0 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MmachcQ9CZD0 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MmachcQ9CZD0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MmachcQ9CZD0 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MmachcQ9CZD0 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MmachcQ9CZD0 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MmachcQ9CZD0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MmachcQ9CZD0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MmachcQ9CZD0 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MmachcQ9CZD0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MmachcQ9CZD0 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MmachcQ9CZD0 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MmachcQ9CZD0 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MmachcQ9CZD0 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MmachcQ9CZD0 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MmachcQ9CZD0 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MmachcQ9CZD0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MmachcQ9CZD0 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MmachcQ9CZD0 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MmachcQ9CZD0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MmachcQ9CZD0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MmachcQ9CZD0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MmachcQ9CZD0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MmachcQ9CZD0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MmachcQ9CZD0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MmachcQ9CZD0 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MmachcQ9CZD0 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MmachcQ9CZD0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MmachcQ9CZD0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MmachcQ9CZD0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MmachcQ9CZD0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MmachcQ9CZD0 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MmachcQ9CZD0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MmachcQ9CZD0 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MmachcQ9CZD0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MmachcQ9CZD0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MmachcQ9CZD0 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MmachcQ9CZD0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MmachcQ9CZD0 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MmachcQ9CZD0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MmachcQ9CZD0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MmachcQ9CZD0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MmachcQ9CZD0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MmachcQ9CZD0 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MmachcQ9CZD0 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MmachcQ9CZD0 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MmachcQ9CZD0 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MmachcQ9CZD0 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MmachcQ9CZD0 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MmachcQ9CZD0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MmachcQ9CZD0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MmachcQ9CZD0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MmachcQ9CZD0 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MmachcQ9CZD0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MmachcQ9CZD0 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MmachcQ9CZD0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MmachcQ9CZD0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MmachcQ9CZD0 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MmachcQ9CZD0 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MmachcQ9CZD0 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MmachcQ9CZD0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MmachcQ9CZD0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MmachcQ9CZD0 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MmachcQ9CZD0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MmachcQ9CZD0 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MmachcQ9CZD0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MmachcQ9CZD0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MmachcQ9CZD0 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MmachcQ9CZD0 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MmachcQ9CZD0 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MmachcQ9CZD0 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MmachcQ9CZD0 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MmachcQ9CZD0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MmachcQ9CZD0 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MmachcQ9CZD0 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MmachcQ9CZD0 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MmachcQ9CZD0 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MmachcQ9CZD0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MmachcQ9CZD0 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MmachcQ9CZD0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MmachcQ9CZD0 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MmachcQ9CZD0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MmachcQ9CZD0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MmachcQ9CZD0 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MmachcQ9CZD0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms