Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY34

Ube2f, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F, mousemouse

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2fQ9CY34 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Ube2fQ9CY34 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Ube2fQ9CY34 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ube2fQ9CY34 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms