Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXT8

Pmpcb, Mitochondrial-processing peptidase subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmpcbQ9CXT8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PmpcbQ9CXT8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PmpcbQ9CXT8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PmpcbQ9CXT8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PmpcbQ9CXT8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PmpcbQ9CXT8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PmpcbQ9CXT8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PmpcbQ9CXT8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PmpcbQ9CXT8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PmpcbQ9CXT8 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PmpcbQ9CXT8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PmpcbQ9CXT8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PmpcbQ9CXT8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PmpcbQ9CXT8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PmpcbQ9CXT8 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PmpcbQ9CXT8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PmpcbQ9CXT8 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PmpcbQ9CXT8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PmpcbQ9CXT8 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PmpcbQ9CXT8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PmpcbQ9CXT8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PmpcbQ9CXT8 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PmpcbQ9CXT8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PmpcbQ9CXT8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PmpcbQ9CXT8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PmpcbQ9CXT8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PmpcbQ9CXT8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PmpcbQ9CXT8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PmpcbQ9CXT8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PmpcbQ9CXT8 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PmpcbQ9CXT8 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PmpcbQ9CXT8 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
PmpcbQ9CXT8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PmpcbQ9CXT8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PmpcbQ9CXT8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PmpcbQ9CXT8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PmpcbQ9CXT8 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PmpcbQ9CXT8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PmpcbQ9CXT8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PmpcbQ9CXT8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PmpcbQ9CXT8 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PmpcbQ9CXT8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PmpcbQ9CXT8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PmpcbQ9CXT8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PmpcbQ9CXT8 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PmpcbQ9CXT8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PmpcbQ9CXT8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PmpcbQ9CXT8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PmpcbQ9CXT8 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PmpcbQ9CXT8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PmpcbQ9CXT8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PmpcbQ9CXT8 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PmpcbQ9CXT8 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PmpcbQ9CXT8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PmpcbQ9CXT8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PmpcbQ9CXT8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PmpcbQ9CXT8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PmpcbQ9CXT8 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PmpcbQ9CXT8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PmpcbQ9CXT8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PmpcbQ9CXT8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PmpcbQ9CXT8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PmpcbQ9CXT8 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PmpcbQ9CXT8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PmpcbQ9CXT8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PmpcbQ9CXT8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PmpcbQ9CXT8 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PmpcbQ9CXT8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PmpcbQ9CXT8 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PmpcbQ9CXT8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PmpcbQ9CXT8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PmpcbQ9CXT8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PmpcbQ9CXT8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PmpcbQ9CXT8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PmpcbQ9CXT8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PmpcbQ9CXT8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PmpcbQ9CXT8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PmpcbQ9CXT8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PmpcbQ9CXT8 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PmpcbQ9CXT8 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PmpcbQ9CXT8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PmpcbQ9CXT8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PmpcbQ9CXT8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PmpcbQ9CXT8 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PmpcbQ9CXT8 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PmpcbQ9CXT8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PmpcbQ9CXT8 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PmpcbQ9CXT8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PmpcbQ9CXT8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PmpcbQ9CXT8 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PmpcbQ9CXT8 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PmpcbQ9CXT8 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PmpcbQ9CXT8 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PmpcbQ9CXT8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PmpcbQ9CXT8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PmpcbQ9CXT8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PmpcbQ9CXT8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PmpcbQ9CXT8 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PmpcbQ9CXT8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PmpcbQ9CXT8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms