Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prkrip1Q9CWV6 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prkrip1Q9CWV6 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prkrip1Q9CWV6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prkrip1Q9CWV6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prkrip1Q9CWV6 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prkrip1Q9CWV6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prkrip1Q9CWV6 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prkrip1Q9CWV6 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prkrip1Q9CWV6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prkrip1Q9CWV6 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prkrip1Q9CWV6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prkrip1Q9CWV6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prkrip1Q9CWV6 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prkrip1Q9CWV6 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prkrip1Q9CWV6 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prkrip1Q9CWV6 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prkrip1Q9CWV6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prkrip1Q9CWV6 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prkrip1Q9CWV6 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prkrip1Q9CWV6 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prkrip1Q9CWV6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prkrip1Q9CWV6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prkrip1Q9CWV6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prkrip1Q9CWV6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prkrip1Q9CWV6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prkrip1Q9CWV6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prkrip1Q9CWV6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prkrip1Q9CWV6 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prkrip1Q9CWV6 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prkrip1Q9CWV6 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Prkrip1Q9CWV6 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Prkrip1Q9CWV6 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Prkrip1Q9CWV6 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Prkrip1Q9CWV6 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prkrip1Q9CWV6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prkrip1Q9CWV6 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prkrip1Q9CWV6 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prkrip1Q9CWV6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prkrip1Q9CWV6 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prkrip1Q9CWV6 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prkrip1Q9CWV6 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prkrip1Q9CWV6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prkrip1Q9CWV6 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prkrip1Q9CWV6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prkrip1Q9CWV6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prkrip1Q9CWV6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prkrip1Q9CWV6 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prkrip1Q9CWV6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prkrip1Q9CWV6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prkrip1Q9CWV6 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prkrip1Q9CWV6 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prkrip1Q9CWV6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prkrip1Q9CWV6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prkrip1Q9CWV6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prkrip1Q9CWV6 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prkrip1Q9CWV6 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prkrip1Q9CWV6 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prkrip1Q9CWV6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prkrip1Q9CWV6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prkrip1Q9CWV6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prkrip1Q9CWV6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prkrip1Q9CWV6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prkrip1Q9CWV6 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prkrip1Q9CWV6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prkrip1Q9CWV6 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prkrip1Q9CWV6 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prkrip1Q9CWV6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prkrip1Q9CWV6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prkrip1Q9CWV6 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prkrip1Q9CWV6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prkrip1Q9CWV6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prkrip1Q9CWV6 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Prkrip1Q9CWV6 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Prkrip1Q9CWV6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prkrip1Q9CWV6 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prkrip1Q9CWV6 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prkrip1Q9CWV6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prkrip1Q9CWV6 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prkrip1Q9CWV6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prkrip1Q9CWV6 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prkrip1Q9CWV6 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prkrip1Q9CWV6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prkrip1Q9CWV6 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prkrip1Q9CWV6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prkrip1Q9CWV6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prkrip1Q9CWV6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prkrip1Q9CWV6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prkrip1Q9CWV6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prkrip1Q9CWV6 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prkrip1Q9CWV6 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prkrip1Q9CWV6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prkrip1Q9CWV6 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prkrip1Q9CWV6 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prkrip1Q9CWV6 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prkrip1Q9CWV6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Prkrip1Q9CWV6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prkrip1Q9CWV6 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prkrip1Q9CWV6 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prkrip1Q9CWV6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms