Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUH1

4930553M12Rik, RIKEN cDNA 4930553M12 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930553M12RikQ9CUH1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930553M12RikQ9CUH1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930553M12RikQ9CUH1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930553M12RikQ9CUH1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930553M12RikQ9CUH1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930553M12RikQ9CUH1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930553M12RikQ9CUH1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930553M12RikQ9CUH1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930553M12RikQ9CUH1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
4930553M12RikQ9CUH1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930553M12RikQ9CUH1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930553M12RikQ9CUH1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930553M12RikQ9CUH1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930553M12RikQ9CUH1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930553M12RikQ9CUH1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930553M12RikQ9CUH1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930553M12RikQ9CUH1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930553M12RikQ9CUH1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930553M12RikQ9CUH1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930553M12RikQ9CUH1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930553M12RikQ9CUH1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
4930553M12RikQ9CUH1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
4930553M12RikQ9CUH1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
4930553M12RikQ9CUH1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930553M12RikQ9CUH1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930553M12RikQ9CUH1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930553M12RikQ9CUH1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930553M12RikQ9CUH1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930553M12RikQ9CUH1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930553M12RikQ9CUH1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
4930553M12RikQ9CUH1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
4930553M12RikQ9CUH1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930553M12RikQ9CUH1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930553M12RikQ9CUH1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930553M12RikQ9CUH1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930553M12RikQ9CUH1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930553M12RikQ9CUH1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930553M12RikQ9CUH1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930553M12RikQ9CUH1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930553M12RikQ9CUH1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930553M12RikQ9CUH1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
4930553M12RikQ9CUH1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930553M12RikQ9CUH1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930553M12RikQ9CUH1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930553M12RikQ9CUH1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930553M12RikQ9CUH1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930553M12RikQ9CUH1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930553M12RikQ9CUH1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
4930553M12RikQ9CUH1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930553M12RikQ9CUH1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930553M12RikQ9CUH1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930553M12RikQ9CUH1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930553M12RikQ9CUH1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930553M12RikQ9CUH1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930553M12RikQ9CUH1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930553M12RikQ9CUH1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930553M12RikQ9CUH1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930553M12RikQ9CUH1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
4930553M12RikQ9CUH1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930553M12RikQ9CUH1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930553M12RikQ9CUH1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930553M12RikQ9CUH1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930553M12RikQ9CUH1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930553M12RikQ9CUH1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
4930553M12RikQ9CUH1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930553M12RikQ9CUH1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
4930553M12RikQ9CUH1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930553M12RikQ9CUH1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930553M12RikQ9CUH1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930553M12RikQ9CUH1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930553M12RikQ9CUH1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930553M12RikQ9CUH1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930553M12RikQ9CUH1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930553M12RikQ9CUH1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930553M12RikQ9CUH1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930553M12RikQ9CUH1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930553M12RikQ9CUH1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930553M12RikQ9CUH1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930553M12RikQ9CUH1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930553M12RikQ9CUH1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930553M12RikQ9CUH1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930553M12RikQ9CUH1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930553M12RikQ9CUH1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930553M12RikQ9CUH1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930553M12RikQ9CUH1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
4930553M12RikQ9CUH1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930553M12RikQ9CUH1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
4930553M12RikQ9CUH1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930553M12RikQ9CUH1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930553M12RikQ9CUH1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930553M12RikQ9CUH1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
4930553M12RikQ9CUH1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930553M12RikQ9CUH1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930553M12RikQ9CUH1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930553M12RikQ9CUH1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930553M12RikQ9CUH1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930553M12RikQ9CUH1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930553M12RikQ9CUH1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930553M12RikQ9CUH1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930553M12RikQ9CUH1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms