Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUB6

Otud1, OTU domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud1Q9CUB6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Otud1Q9CUB6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Otud1Q9CUB6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Otud1Q9CUB6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Otud1Q9CUB6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Otud1Q9CUB6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Otud1Q9CUB6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Otud1Q9CUB6 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Otud1Q9CUB6 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Otud1Q9CUB6 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Otud1Q9CUB6 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Otud1Q9CUB6 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Otud1Q9CUB6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Otud1Q9CUB6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Otud1Q9CUB6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Otud1Q9CUB6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Otud1Q9CUB6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Otud1Q9CUB6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Otud1Q9CUB6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Otud1Q9CUB6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Otud1Q9CUB6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Otud1Q9CUB6 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Otud1Q9CUB6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Otud1Q9CUB6 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Otud1Q9CUB6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Otud1Q9CUB6 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Otud1Q9CUB6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Otud1Q9CUB6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Otud1Q9CUB6 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Otud1Q9CUB6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Otud1Q9CUB6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Otud1Q9CUB6 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Otud1Q9CUB6 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Otud1Q9CUB6 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Otud1Q9CUB6 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Otud1Q9CUB6 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Otud1Q9CUB6 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Otud1Q9CUB6 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Otud1Q9CUB6 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Otud1Q9CUB6 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Otud1Q9CUB6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Otud1Q9CUB6 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Otud1Q9CUB6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Otud1Q9CUB6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Otud1Q9CUB6 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Otud1Q9CUB6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Otud1Q9CUB6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otud1Q9CUB6 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Otud1Q9CUB6 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otud1Q9CUB6 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otud1Q9CUB6 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otud1Q9CUB6 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otud1Q9CUB6 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otud1Q9CUB6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otud1Q9CUB6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otud1Q9CUB6 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otud1Q9CUB6 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otud1Q9CUB6 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otud1Q9CUB6 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Otud1Q9CUB6 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otud1Q9CUB6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otud1Q9CUB6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otud1Q9CUB6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otud1Q9CUB6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otud1Q9CUB6 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otud1Q9CUB6 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Otud1Q9CUB6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Otud1Q9CUB6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Otud1Q9CUB6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Otud1Q9CUB6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Otud1Q9CUB6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Otud1Q9CUB6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Otud1Q9CUB6 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Otud1Q9CUB6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Otud1Q9CUB6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Otud1Q9CUB6 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Otud1Q9CUB6 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Otud1Q9CUB6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Otud1Q9CUB6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Otud1Q9CUB6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms