Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rhobtb3Q9CTN4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rhobtb3Q9CTN4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rhobtb3Q9CTN4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rhobtb3Q9CTN4 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rhobtb3Q9CTN4 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rhobtb3Q9CTN4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rhobtb3Q9CTN4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rhobtb3Q9CTN4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rhobtb3Q9CTN4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rhobtb3Q9CTN4 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rhobtb3Q9CTN4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rhobtb3Q9CTN4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rhobtb3Q9CTN4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rhobtb3Q9CTN4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Rhobtb3Q9CTN4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rhobtb3Q9CTN4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rhobtb3Q9CTN4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rhobtb3Q9CTN4 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rhobtb3Q9CTN4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rhobtb3Q9CTN4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rhobtb3Q9CTN4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rhobtb3Q9CTN4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rhobtb3Q9CTN4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rhobtb3Q9CTN4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rhobtb3Q9CTN4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rhobtb3Q9CTN4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rhobtb3Q9CTN4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rhobtb3Q9CTN4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rhobtb3Q9CTN4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Rhobtb3Q9CTN4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rhobtb3Q9CTN4 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Rhobtb3Q9CTN4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rhobtb3Q9CTN4 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rhobtb3Q9CTN4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rhobtb3Q9CTN4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rhobtb3Q9CTN4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rhobtb3Q9CTN4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rhobtb3Q9CTN4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rhobtb3Q9CTN4 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rhobtb3Q9CTN4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rhobtb3Q9CTN4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rhobtb3Q9CTN4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rhobtb3Q9CTN4 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rhobtb3Q9CTN4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Rhobtb3Q9CTN4 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rhobtb3Q9CTN4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Rhobtb3Q9CTN4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rhobtb3Q9CTN4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rhobtb3Q9CTN4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rhobtb3Q9CTN4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rhobtb3Q9CTN4 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rhobtb3Q9CTN4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rhobtb3Q9CTN4 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rhobtb3Q9CTN4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rhobtb3Q9CTN4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Rhobtb3Q9CTN4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rhobtb3Q9CTN4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rhobtb3Q9CTN4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rhobtb3Q9CTN4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Rhobtb3Q9CTN4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rhobtb3Q9CTN4 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rhobtb3Q9CTN4 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rhobtb3Q9CTN4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rhobtb3Q9CTN4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rhobtb3Q9CTN4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rhobtb3Q9CTN4 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rhobtb3Q9CTN4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rhobtb3Q9CTN4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rhobtb3Q9CTN4 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Rhobtb3Q9CTN4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rhobtb3Q9CTN4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rhobtb3Q9CTN4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rhobtb3Q9CTN4 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rhobtb3Q9CTN4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rhobtb3Q9CTN4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rhobtb3Q9CTN4 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rhobtb3Q9CTN4 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rhobtb3Q9CTN4 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rhobtb3Q9CTN4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rhobtb3Q9CTN4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rhobtb3Q9CTN4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rhobtb3Q9CTN4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rhobtb3Q9CTN4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rhobtb3Q9CTN4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rhobtb3Q9CTN4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rhobtb3Q9CTN4 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Rhobtb3Q9CTN4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rhobtb3Q9CTN4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rhobtb3Q9CTN4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rhobtb3Q9CTN4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rhobtb3Q9CTN4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rhobtb3Q9CTN4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rhobtb3Q9CTN4 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rhobtb3Q9CTN4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rhobtb3Q9CTN4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Rhobtb3Q9CTN4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms