Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR22

Tmem42, Transmembrane protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem42Q9CR22 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem42Q9CR22 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms