Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ7

Atp5f1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5f1Q9CQQ7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp5f1Q9CQQ7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp5f1Q9CQQ7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp5f1Q9CQQ7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp5f1Q9CQQ7 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms