Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF0

Mrpl11, 39S ribosomal protein L11, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl11Q9CQF0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mrpl11Q9CQF0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mrpl11Q9CQF0 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Mrpl11Q9CQF0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mrpl11Q9CQF0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mrpl11Q9CQF0 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mrpl11Q9CQF0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mrpl11Q9CQF0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mrpl11Q9CQF0 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mrpl11Q9CQF0 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mrpl11Q9CQF0 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mrpl11Q9CQF0 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mrpl11Q9CQF0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mrpl11Q9CQF0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mrpl11Q9CQF0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mrpl11Q9CQF0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mrpl11Q9CQF0 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Mrpl11Q9CQF0 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mrpl11Q9CQF0 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mrpl11Q9CQF0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mrpl11Q9CQF0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mrpl11Q9CQF0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mrpl11Q9CQF0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mrpl11Q9CQF0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mrpl11Q9CQF0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mrpl11Q9CQF0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mrpl11Q9CQF0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mrpl11Q9CQF0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mrpl11Q9CQF0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mrpl11Q9CQF0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mrpl11Q9CQF0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mrpl11Q9CQF0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mrpl11Q9CQF0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mrpl11Q9CQF0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mrpl11Q9CQF0 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mrpl11Q9CQF0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mrpl11Q9CQF0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mrpl11Q9CQF0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mrpl11Q9CQF0 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mrpl11Q9CQF0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mrpl11Q9CQF0 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mrpl11Q9CQF0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mrpl11Q9CQF0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mrpl11Q9CQF0 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mrpl11Q9CQF0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mrpl11Q9CQF0 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mrpl11Q9CQF0 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mrpl11Q9CQF0 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mrpl11Q9CQF0 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Mrpl11Q9CQF0 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mrpl11Q9CQF0 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mrpl11Q9CQF0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mrpl11Q9CQF0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mrpl11Q9CQF0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mrpl11Q9CQF0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mrpl11Q9CQF0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mrpl11Q9CQF0 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Mrpl11Q9CQF0 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mrpl11Q9CQF0 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mrpl11Q9CQF0 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mrpl11Q9CQF0 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mrpl11Q9CQF0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mrpl11Q9CQF0 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mrpl11Q9CQF0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mrpl11Q9CQF0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mrpl11Q9CQF0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mrpl11Q9CQF0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mrpl11Q9CQF0 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mrpl11Q9CQF0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mrpl11Q9CQF0 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mrpl11Q9CQF0 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mrpl11Q9CQF0 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Mrpl11Q9CQF0 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Mrpl11Q9CQF0 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Mrpl11Q9CQF0 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Mrpl11Q9CQF0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mrpl11Q9CQF0 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mrpl11Q9CQF0 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mrpl11Q9CQF0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mrpl11Q9CQF0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mrpl11Q9CQF0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mrpl11Q9CQF0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mrpl11Q9CQF0 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mrpl11Q9CQF0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mrpl11Q9CQF0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Mrpl11Q9CQF0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mrpl11Q9CQF0 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mrpl11Q9CQF0 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mrpl11Q9CQF0 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Mrpl11Q9CQF0 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mrpl11Q9CQF0 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mrpl11Q9CQF0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mrpl11Q9CQF0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mrpl11Q9CQF0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mrpl11Q9CQF0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mrpl11Q9CQF0 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Mrpl11Q9CQF0 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mrpl11Q9CQF0 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mrpl11Q9CQF0 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mrpl11Q9CQF0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms