Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ90

Uncharacterized protein C9orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQ90 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CQ90 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CQ90 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CQ90 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CQ90 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CQ90 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Gm17555-201ENSMUST00000164042 1113 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CQ90 2010110E17Rik-201ENSMUST00000184161 879 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CQ90 AU017674-201ENSMUST00000222864 720 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Olfr128-201ENSMUST00000080231 1050 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CQ90 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CQ90 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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